RNA–Protein interactions for RNA: 21S_rRNA

21S_rRNA, Mitochondrial 21S rRNA, yeastyeast

Gene 21S_rRNA, Length 3,296 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
21S_rRNA21S_rRNA RPO31P04051 1460 aa1.11□□□□□ -2.23
21S_rRNA21S_rRNA SCC2Q04002 1493 aa1.11□□□□□ -2.23
21S_rRNA21S_rRNA RPC10P40422 70 aa1.1□□□□□ -2.23
21S_rRNA21S_rRNA PAI3P01094 68 aa1.09□□□□□ -2.23
21S_rRNA21S_rRNA QCR9P22289 66 aa1.09□□□□□ -2.23
21S_rRNA21S_rRNA BLM10P43583 2143 aa1.08□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA HKR1P41809 1802 aa1.07□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA COX7P10174 60 aa1.07□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA ATP18P81450 59 aa1.07□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA YFL041W-AQ3E817 63 aa1.06□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA PDR12Q02785 1511 aa1.06□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA YDR246W-AQ3E763 66 aa1.06□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA YNL198CP40166 100 aa1.05□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA VPS15P22219 1454 aa1.05□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA APC1P53886 1748 aa1.04□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA YOR032W-AQ8TGS1 66 aa1.03□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA ERI1P62651 68 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA RPO21P04050 1733 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
21S_rRNA21S_rRNA ATX1P38636 73 aa1.02□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA DNF2Q12675 1612 aa1.02□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA SPI1P40092 148 aa1.02□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA IML1P47170 1584 aa1.01□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YFR010W-AP0C5N0 62 aa1.01□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA SSS1P35179 80 aa1.01□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA RPL38P49167 78 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YOL164W-AQ3E7A5 60 aa1.01□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YKL018C-AQ3E7A7 99 aa1□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA SGF11Q03067 99 aa0.99□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA MYO4P32492 1471 aa0.98□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA ATP17Q06405 101 aa0.98□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa0.98□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YOL131WQ08270 108 aa0.97□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YBR016WP38216 128 aa0.97□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA SDH6Q3E785 79 aa0.97□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA BPH1P25356 2167 aa0.97□□□□□ -2.25
21S_rRNA21S_rRNA YJR107C-AP0CT86 78 aa0.96□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA YPR108W-AQ3E7B3 70 aa0.96□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA IQG1Q12280 1495 aa0.94□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA PAU7P39545 55 aa0.94□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA TY1B-DR4Q07793 1604 aa0.93□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA YBR032WP38223 100 aa0.91□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA SPO14P36126 1683 aa0.91□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA TY3B-GQ99315 1547 aa0.9□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA EDC1P53080 175 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.26
21S_rRNA21S_rRNA YSY6P38374 65 aa0.88□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA VMR1P38735 1592 aa0.88□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA VTH1P40438 1549 aa0.88□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA VTH2P40890 1549 aa0.88□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA YIL102C-AQ2V2P5 75 aa0.88□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA SMC4Q12267 1418 aa0.87□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA RPS27AP35997 82 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA IRC20Q06554 1556 aa0.87□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA YBT1P32386 1661 aa0.87□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA BCK1Q01389 1478 aa0.86□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA YFR009W-AP0C5M9 85 aa0.86□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA YBR200W-AQ3E755 54 aa0.86□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA VMA9Q3E7B6 73 aa0.86□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA YDR182W-AQ3E796 67 aa0.86□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA MON2P48563 1636 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa0.84□□□□□ -2.27
21S_rRNA21S_rRNA MMS1Q06211 1407 aa0.84□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA HAP1P0CE41 1502 aa0.83□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA CDC25P04821 1589 aa0.82□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YCF1P39109 1515 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YBL044WP38194 122 aa0.81□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YIL134C-AQ45U18 67 aa0.81□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YBL039W-BP0C268 59 aa0.81□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YOR011W-AQ3E807 68 aa0.81□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA KOG1P38873 1557 aa0.81□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA NUP188P52593 1655 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA HUB1Q6Q546 73 aa0.79□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa0.79□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA PRP8P33334 2413 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA PDR5P33302 1511 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
21S_rRNA21S_rRNA YLR146W-AQ2V2P1 62 aa0.77□□□□□ -2.29
21S_rRNA21S_rRNA SPT6P23615 1451 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
21S_rRNA21S_rRNA YGR025WP53216 100 aa0.76□□□□□ -2.29
21S_rRNA21S_rRNA YOR093CQ12275 1648 aa0.75□□□□□ -2.29
21S_rRNA21S_rRNA PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
21S_rRNA21S_rRNA SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
21S_rRNA21S_rRNA YOR192C-CQ3E736 78 aa0.71□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA YKL023C-AQ2V2P3 75 aa0.7□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA YMR001C-AQ8TGS9 76 aa0.7□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA USO1P25386 1790 aa0.7□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA RPS27BP38711 82 aa0.69□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA YCR108CQ3E819 63 aa0.65□□□□□ -2.3
21S_rRNA21S_rRNA OLI1P61829 76 aa0.65□□□□□ -2.31
21S_rRNA21S_rRNA YLR157W-DP0CE99 70 aa0.65□□□□□ -2.31
21S_rRNA21S_rRNA SSK2P53599 1579 aa0.64□□□□□ -2.31
21S_rRNA21S_rRNA PEP1P32319 1579 aa0.63□□□□□ -2.31
21S_rRNA21S_rRNA ULS1Q08562 1619 aa0.63□□□□□ -2.31
21S_rRNA21S_rRNA NUP192P47054 1683 aa0.58□□□□□ -2.32
21S_rRNA21S_rRNA YBR230W-AQ3E762 66 aa0.56□□□□□ -2.32
21S_rRNA21S_rRNA SIP18P50263 79 aa0.55□□□□□ -2.32
21S_rRNA21S_rRNA BUD3P25558 1636 aa0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.3 ms