RNA–Protein interactions for RNA: YMR199W

CLN1, Transcript of G1 cyclin involved in regulation of the cell cycle, yeast

Gene CLN1, Length 1,641 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLN1	YMR199W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	KRE9	P39005	276 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	RGM1	Q00453	211 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YAL065C	O13511	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	RSM18	P40033	138 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YFL015C	P43578	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YNL234W	P53857	426 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	SRL1	Q08673	210 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YKR045C	P36138	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YER084W	P40057	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YOR314W	Q12506	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YOL160W	Q08321	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	SPG4	Q04438	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YLR162W	Q06235	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YDR274C	P87283	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CLN1	YMR199W	YBR144C	P34215	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	MRPL39	P36533	70 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	RPB9	P27999	122 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	BLM10	P43583	2143 aa		5	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	MPC3	P53311	146 aa		5	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		5	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		5	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		5	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	SIP18	P50263	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	ATP18	P81450	59 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	CRC1	Q12289	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YEL008W	P40001	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	RNH203	Q12338	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YHL005C	P38752	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	POR2	P40478	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	YFR035C	P43608	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLN1	YMR199W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	RPR2	P40571	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YGL088W	P53151	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	DIF1	O13577	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	TDA2	P40045	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YIR020C	P40575	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YMR122C	Q03879	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	RPL39	P04650	51 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	OST5	Q92316	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	TOS8	P53147	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YGR025W	P53216	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	COX14	P39103	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YGL034C	P53186	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	SED1	Q01589	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	CCW12	Q12127	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YEL045C	P32616	141 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YPS5	P53057	165 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLN1	YMR199W	YPR153W	Q06537	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	UTH1	P36135	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	YHL037C	P38733	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	SPG1	P50088	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	YGL193C	P53097	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	VAM10	Q08474	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLN1	YMR199W	PMP3	P87284	55 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLN1	YMR199W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLN1	YMR199W	HOT13	P36078	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLN1	YMR199W	YAL064W	P39711	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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