RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W TRA1P38811 3744 aa9.58□□□□□ -0.88
SSA4YER103W MIG3P39943 394 aa9.57□□□□□ -0.88
SSA4YER103W SBH1P52870 82 aa9.57□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YOR020W-AQ3E824 90 aa9.57□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YMR295CQ03559 197 aa9.56□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YLR236CA0A023PZG4 107 aa9.56□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YFR035CP43608 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SSA4YER103W UBC11P52492 156 aa9.56□□□□□ -0.88
SSA4YER103W IRC21Q04772 201 aa9.56□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YLR285C-AQ3E771 56 aa9.56□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YJR107C-AP0CT86 78 aa9.55□□□□□ -0.88
SSA4YER103W TOS8P53147 276 aa9.55□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YER187WP40102 141 aa9.54□□□□□ -0.88
SSA4YER103W RPR2P40571 144 aa9.54□□□□□ -0.88
SSA4YER103W YMR244WQ04018 355 aa9.54□□□□□ -0.88
SSA4YER103W COX14P39103 70 aa9.53□□□□□ -0.88
SSA4YER103W PMP3P87284 55 aa9.51□□□□□ -0.89
SSA4YER103W MRPS8Q03799 155 aa9.51□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YBR121C-AP0C5L4 52 aa9.5□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YLL006W-AQ3E814 58 aa9.5□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YLR156WP0CE96 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YLR159WP0CE97 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YLR161WP0CE98 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YBR219CP38317 127 aa9.48□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YLR281CQ05863 155 aa9.48□□□□□ -0.89
SSA4YER103W SPS100P13130 326 aa9.47□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YAR029WP39549 74 aa9.47□□□□□ -0.89
SSA4YER103W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SSA4YER103W VAM10Q08474 114 aa9.46□□□□□ -0.89
SSA4YER103W YDR246W-AQ3E763 66 aa9.46□□□□□ -0.89
SSA4YER103W HAL1Q01766 294 aa9.46□□□□□ -0.9
SSA4YER103W YIR020CP40575 100 aa9.45□□□□□ -0.9
SSA4YER103W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W MPC3P53311 146 aa9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W YMR175W-AQ3E766 64 aa9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W YGL260WP53056 76 aa9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W HOR7Q05827 59 aa9.44□□□□□ -0.9
SSA4YER103W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data9.43□□□□□ -0.9not detected
SSA4YER103W ATP18P81450 59 aa9.43□□□□□ -0.9
SSA4YER103W YPR117WQ06116 2489 aa9.43□□□□□ -0.9
SSA4YER103W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SSA4YER103W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SSA4YER103W KTI11Q3E840 82 aa9.41□□□□□ -0.9
SSA4YER103W BET1P22804 142 aa9.4□□□□□ -0.9
SSA4YER103W GAT4P40569 121 aa9.4□□□□□ -0.9
SSA4YER103W ATP20Q12233 115 aa9.4□□□□□ -0.9
SSA4YER103W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SSA4YER103W ALG13P53178 202 aa9.39□□□□□ -0.91
SSA4YER103W TAR1Q8TGM6 124 aa9.38□□□□□ -0.91
SSA4YER103W SPG4Q04438 115 aa9.37□□□□□ -0.91
SSA4YER103W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SSA4YER103W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SSA4YER103W ICY1Q04329 127 aa9.35□□□□□ -0.91
SSA4YER103W SRL1Q08673 210 aa9.35□□□□□ -0.91
SSA4YER103W ERG28P40030 148 aa9.34□□□□□ -0.91
SSA4YER103W RPL38P49167 78 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SSA4YER103W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SSA4YER103W UBC4P15731 148 aa9.33□□□□□ -0.92
SSA4YER103W YPS5P53057 165 aa9.33□□□□□ -0.92
SSA4YER103W TIM10P87108 93 aa9.33□□□□□ -0.92
SSA4YER103W KSH1Q8TGJ3 72 aa9.33□□□□□ -0.92
SSA4YER103W YFR009W-AP0C5M9 85 aa9.33□□□□□ -0.92
SSA4YER103W YKL183C-AQ3E765 70 aa9.32□□□□□ -0.92
SSA4YER103W YAL065CO13511 128 aa9.3□□□□□ -0.92
SSA4YER103W ERI1P62651 68 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SSA4YER103W RSM18P40033 138 aa9.29□□□□□ -0.92
SSA4YER103W YLR412C-AQ3E742 68 aa9.29□□□□□ -0.92
SSA4YER103W YMR122W-AQ3E842 84 aa9.29□□□□□ -0.92
SSA4YER103W TDA2P40045 126 aa9.27□□□□□ -0.93
SSA4YER103W TSC3Q3E790 80 aa9.27□□□□□ -0.93
SSA4YER103W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SSA4YER103W YGR164WP53291 111 aa9.25□□□□□ -0.93
SSA4YER103W TDA8Q6B2U8 126 aa9.25□□□□□ -0.93
SSA4YER103W YPL278CQ08990 100 aa9.24□□□□□ -0.93
SSA4YER103W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SSA4YER103W URA2P07259 2214 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SSA4YER103W CRC1Q12289 327 aa9.23□□□□□ -0.93
SSA4YER103W YOR314WQ12506 109 aa9.23□□□□□ -0.93
SSA4YER103W YFL019CP43576 117 aa9.22□□□□□ -0.93
SSA4YER103W RTG1P32607 177 aa9.21□□□□□ -0.94
SSA4YER103W SPO24Q3E752 67 aa9.21□□□□□ -0.94
SSA4YER103W MVB12P42939 101 aa9.19□□□□□ -0.94
SSA4YER103W YDL241WQ07738 123 aa9.18□□□□□ -0.94
SSA4YER103W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SSA4YER103W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa9.17□□□□□ -0.94
SSA4YER103W YCR041WP37265 110 aa9.15□□□□□ -0.94
SSA4YER103W ICS3P47034 131 aa9.15□□□□□ -0.94
SSA4YER103W YDR182W-AQ3E796 67 aa9.15□□□□□ -0.94
SSA4YER103W YGR240C-AQ3E786 66 aa9.15□□□□□ -0.95
SSA4YER103W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
SSA4YER103W YMR320WQ04897 101 aa9.14□□□□□ -0.95
SSA4YER103W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SSA4YER103W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SSA4YER103W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa9.13□□□□□ -0.95
SSA4YER103W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa9.12□□□□□ -0.95
SSA4YER103W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
SSA4YER103W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
SSA4YER103W YOL014WQ08110 124 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.6 ms