RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PAU1P0CE88 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU14P0CE89 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU8P0CE92 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU11P0CE93 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YBR292CP38357 123 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU13P38725 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU10Q03050 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU20Q08322 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU9Q3E770 120 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YNR034W-AQ3E841 98 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W MMS22Q06164 1454 aa0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W THO2P53552 1597 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-BRQ12193 1756 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TOM1Q03280 3268 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W VPS13Q07878 3144 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RPA12P32529 125 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W SHU1P38751 150 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YHR173CP38864 112 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU4P53427 120 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W BSC4P53841 131 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W COX19Q3E731 98 aa0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W DNF3Q12674 1656 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RPO31P04051 1460 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W SNF2P22082 1703 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-MR1Q04214 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-NL1Q12112 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-GR1Q12141 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-GR3Q12316 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-BLQ12490 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-ORQ92393 1755 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YLR255CO13574 117 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W MPC2P38857 129 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W CWP2P43497 92 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YKL068W-AQ3E826 78 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W MOT1P32333 1867 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W DOP1Q03921 1698 aa0.56□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RIM15P43565 1770 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W ECM29P38737 1868 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W CUP1-1P0CX80 61 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W CUP1-2P0CX81 61 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YHR214C-DP0CX93 97 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YCR085WP25650 117 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PDX3P38075 228 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YOR343CQ12484 108 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YMR175W-AQ3E766 64 aa0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W SSK2P53599 1579 aa0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W RKR1Q04781 1562 aa0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-DR4Q07793 1604 aa0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W FPR2P32472 135 aa0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TOM6P33448 61 aa0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W POL2P21951 2222 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W NUP159P40477 1460 aa0.54□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PEP1P32319 1579 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W COX7P10174 60 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU23Q07987 124 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YOR105WQ08504 108 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W PAU17Q12370 124 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W Q0032Q9ZZX7 96 aa0.53□□□□□ -2.32
NSE4YDL105W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-JR1P47098 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-ER1Q03612 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-ER2Q03619 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-DR1Q03855 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-GR2Q12269 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-OLQ12273 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W TY1B-DR3Q99231 1755 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W VPS15P22219 1454 aa0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
NSE4YDL105W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
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