RNA–Protein interactions for RNA: YJL039C

NUP192, Transcript of Essential subunit of the inner ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP192, Length 5,052 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP192	YJL039C	RRT15	Q3E811	62 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	CWP2	P43497	92 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YLR112W	Q12130	139 aa		0.93	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	GCN3	P14741	305 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PET8	P38921	284 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU4	P53427	120 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YAL065C	O13511	128 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	SCM4	P32564	187 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	DID2	P69771	204 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	QCR8	P08525	94 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	UGX2	P32772	223 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	MGR2	Q02889	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	CTR3	Q06686	241 aa		0.92	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	HSP10	P38910	106 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YGL117W	P53133	265 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU19	P0CE85	124 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU21	P0CE86	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU22	P0CE87	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU3	P25610	124 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PEX17	P40155	199 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU15	P40585	124 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	SHH4	Q06236	168 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAM17	P36147	197 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PGD1	P40356	397 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	UBC11	P52492	156 aa		0.91	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU16	P35994	123 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	CSM4	Q08955	156 aa		0.9	□□□□□ -2.26
NUP192	YJL039C	PAU1	P0CE88	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU14	P0CE89	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU6	P0CE90	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU18	P0CE91	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU8	P0CE92	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU11	P0CE93	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	CNB1	P25296	175 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	SMP1	P38128	452 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU13	P38725	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	COX14	P39103	70 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU10	Q03050	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU20	Q08322	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PAU9	Q3E770	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	MGR3	Q04472	501 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	COX19	Q3E731	98 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	MVB12	P42939	101 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YGR025W	P53216	100 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	RPN13	O13563	156 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YDR210W	Q03482	75 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YKE4	P40544	346 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	PHS1	P40857	217 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	ANT1	Q06497	328 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	KRE1	P17260	313 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	FUN14	P18411	198 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	RPB11	P38902	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	APS2	Q00381	147 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YEL008W	P40001	126 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	LDS1	P31379	325 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	AIM29	P36154	155 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	DAD2	P36162	133 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	DCN1	Q12395	269 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YOP1	Q12402	180 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	SHU1	P38751	150 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	DDR2	P89113	61 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YKL070W	P36087	169 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	COX10	P21592	462 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	YMR141C	P40211	102 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	CGR1	P53188	120 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	RGM1	Q00453	211 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	ARL3	Q02804	198 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NUP192	YJL039C	ATP16	Q12165	160 aa		0.86	□□□□□ -2.27

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