RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	GAT4	P40569	121 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	FRQ1	Q06389	190 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	ACP1	P32463	125 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	SRX1	P36077	127 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YIL163C	P40448	117 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	APS2	Q00381	147 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	SPC24	Q04477	213 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YLR118C	Q12354	227 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	OCA6	Q12454	224 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	GSC2	P40989	1895 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	ENV10	Q99382	181 aa		0.49	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	RPB11	P38902	120 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	SNF11	P38956	169 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	TDA2	P40045	126 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	POR2	P40478	281 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	ARL3	Q02804	198 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YLR194C	Q05777	254 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	OST5	Q92316	86 aa		0.48	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YCR099C	P25657	155 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	GTT1	P40582	234 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YJR128W	P47162	119 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YPL261C	Q08976	102 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	DAD1	Q12248	94 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	RTR2	Q12378	196 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.47	□□□□□ -2.33
BRX1	YOL077C	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.46	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	TRS20	P38334	175 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YER187W	P40102	141 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	VPS55	P47111	140 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	SNN1	P48232	102 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	SWC7	Q06707	132 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	PCC1	Q3E833	88 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	ECM5	Q03214	1411 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	LAA1	P39526	2014 aa		0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	DNA2	P38859	1522 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	MDS3	P53094	1487 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	CYB5	P40312	120 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	VMA21	P41806	77 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YFR035C	P43608	114 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YDR010C	Q12426	110 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	SPP41	P38904	1435 aa		0.44	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YEA6	P39953	335 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	COX23	P38824	151 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YHR130C	P38834	111 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YAR029W	P39549	74 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	PAM16	P42949	149 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YGR164W	P53291	111 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	SRB6	P32570	121 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	HUR1	P45820	110 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	PAU12	P53343	120 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	LCL1	Q02786	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YLR042C	Q07990	161 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
BRX1	YOL077C	YIR020C	P40575	100 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	IMP2	P46972	177 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	COX19	Q3E731	98 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	YHR173C	P38864	112 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	YIL086C	P40503	102 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	YOL118C	Q08259	102 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	PAU19	P0CE85	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	PAU3	P25610	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	NTE1	Q04958	1679 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	BPT1	P14772	1559 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	CCW14	O13547	238 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	PAU2	P32612	120 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	PAU24	P38155	120 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	SHU1	P38751	150 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	MRPS12	P53732	153 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	COX12	Q01519	83 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	YOS1	Q3E834	85 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	RUB1	Q03919	77 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BRX1	YOL077C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35

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