RNA–Protein interactions for RNA: YMR179W

SPT21, Transcript of Protein with a role in transcriptional silencing, yeast

Gene SPT21, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT21	YMR179W	FIT3	Q08907	204 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPT21	YMR179W	YMR141C	P40211	102 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPT21	YMR179W	YIL163C	P40448	117 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPT21	YMR179W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPT21	YMR179W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPT21	YMR179W	TRM732	Q03496	1420 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	GSC2	P40989	1895 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PAU12	P53343	120 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YCR099C	P25657	155 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YHR130C	P38834	111 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	TDA2	P40045	126 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PAM16	P42949	149 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	OST5	Q92316	86 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YAR029W	P39549	74 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	ENV10	Q99382	181 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	COX23	P38824	151 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YER187W	P40102	141 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	CYB5	P40312	120 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	POR2	P40478	281 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PAU2	P32612	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	SRX1	P36077	127 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PAU24	P38155	120 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	ICS3	P47034	131 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	SNN1	P48232	102 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	DAD1	Q12248	94 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RTR2	Q12378	196 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	OCA6	Q12454	224 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YIR020C	P40575	100 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	ARL3	Q02804	198 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	NUM1	Q00402	2748 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YJR128W	P47162	119 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	LCL1	Q02786	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	ECM5	Q03214	1411 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	YEA6	P39953	335 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	GTT1	P40582	234 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	RUB1	Q03919	77 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	PAU3	P25610	124 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	VPS55	P47111	140 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SPT21	YMR179W	SPP41	P38904	1435 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	DNA2	P38859	1522 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	MRPS12	P53732	153 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YGR164W	P53291	111 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	LAA1	P39526	2014 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	HUR1	P45820	110 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	PAU16	P35994	123 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	PAU15	P40585	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	VMA21	P41806	77 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	SWC7	Q06707	132 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	AUA1	P32450	94 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YLR255C	O13574	117 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	CCW14	O13547	238 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	LYS2	P07702	1392 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	MDS3	P53094	1487 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SPT21	YMR179W	UBC4	P15731	148 aa		0.35	□□□□□ -2.35

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