RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YHR125W	P38831	101 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	PAM16	P42949	149 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YFR035C	P43608	114 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YGR026W	P53217	278 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YNR064C	P53750	290 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YHP1	Q04116	353 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ANT1	Q06497	328 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	SWC7	Q06707	132 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		1.58	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	CSF1	Q12150	2958 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MSW1	P04803	379 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	STF2	P16965	84 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MRPL44	P19956	98 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YCR050C	P25630	102 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YET1	P35723	206 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	TVP23	P38962	199 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	LIP1	Q03579	150 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ATG10	Q07879	167 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ATO3	Q12359	275 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MED11	Q99278	115 aa		1.57	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	DYN1	P36022	4092 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	TRA1	P38811	3744 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	UMP1	P38293	148 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	CTR2	P38865	189 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	KNH1	P50112	268 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YPL067C	Q02754	198 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MIX14	Q04341	121 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	FIT3	Q08907	204 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YOS1	Q3E834	85 aa		1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MEC1	P38111	2368 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	FLX1	P40464	311 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	SHH3	Q04487	196 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	SML1	Q04964	104 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RAF1	Q06891	181 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ODC2	Q99297	307 aa		1.55	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	HMRA1	P0CY11	126 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RRT1	P38192	103 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YNL217W	P40152	326 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	TIR3	P40552	269 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ERG25	P53045	309 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ATP19	P81451	68 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	GRX5	Q02784	150 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YDR102C	Q03864	110 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	COA4	Q05809	96 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	CSI2	Q08054	341 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YOR385W	Q08909	290 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ATP20	Q12233	115 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		1.54	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	FZF1	P32805	299 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	SNF11	P38956	169 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YAL064W	P39711	94 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YEL073C	P39974	107 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	PIR1	Q03178	341 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	UPS3	Q04006	179 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	SOM1	Q05676	74 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	GPI11	Q06636	219 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	YDR029W	Q12111	104 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	MIC10	Q96VH5	97 aa		1.53	□□□□□ -2.16
YLR224W	YLR224W	ECM12	O13529	151 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	FYV5	P25585	152 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	QCR10	P37299	77 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YBR013C	P38215	129 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	SVP26	P38869	228 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	HUR1	P45820	110 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	GPI19	Q04082	140 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	IRC23	Q08416	157 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YRF1-6	P53819	1859 aa		1.52	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YOL162W	P0CF19	215 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YGL010W	P25338	174 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YKL044W	P36092	106 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YKR045C	P36138	183 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YHL042W	P38729	150 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YEL067C	P39978	195 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	PEP8	P40335	379 aa		1.51	□□□□□ -2.17

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 229.8 ms