RNA–Protein interactions for RNA: YHR140W

YHR140W, Transcript of Putative integral membrane protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHR140W, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WYHR140W PRM3Q08931 133 aa3.47□□□□□ -1.85
YHR140WYHR140W FCY1Q12178 158 aa3.47□□□□□ -1.85
YHR140WYHR140W YLR099W-AQ3E798 87 aa3.47□□□□□ -1.85
YHR140WYHR140W YBR209WP38311 105 aa3.46□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W SPC25P40014 221 aa3.46□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W PAM16P42949 149 aa3.46□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W THI74Q04083 370 aa3.46□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W IRC23Q08416 157 aa3.46□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W PET54P10834 293 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YBL010CP32788 280 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W RPB7P34087 171 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W PAM17P36147 197 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W SLM6P38343 150 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W VMA22P38784 181 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W DSE2P38844 325 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YHP1Q04116 353 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W SHH3Q04487 196 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YMR253CQ04835 414 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YOR192C-CQ3E736 78 aa3.45□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W AUA1P32450 94 aa3.44□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YOL118CQ08259 102 aa3.44□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W RAD28Q12021 506 aa3.44□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YLR365WQ7LIF2 110 aa3.44□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W STF2P16965 84 aa3.43□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W BUD25P85052 153 aa3.43□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W BOL1Q3E793 110 aa3.43□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa3.43□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W ROX3P25046 220 aa3.42□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W HYM1P32464 399 aa3.42□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W KNH1P50112 268 aa3.42□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W ATG41Q12048 136 aa3.42□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YOS1Q3E834 85 aa3.42□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YKR045CP36138 183 aa3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W MPC2P38857 129 aa3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W HRD1Q08109 551 aa3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W ATP20Q12233 115 aa3.41□□□□□ -1.86
YHR140WYHR140W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W KEI1Q06346 221 aa3.4□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W SEC11P15367 167 aa3.39□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W SEN2P16658 377 aa3.39□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
YHR140WYHR140W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W RBL2P48606 106 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W ORM1P53224 222 aa3.39□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YGR042WP53227 271 aa3.39□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W HTD2P38790 280 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YPL073CP40323 161 aa3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W VPS28Q02767 242 aa3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W ANT1Q06497 328 aa3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YOR385WQ08909 290 aa3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W HUG1Q6Q5K6 68 aa3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W SUS1Q6WNK7 96 aa3.37□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W SYM1Q06563 197 aa3.36□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W RRT1P38192 103 aa3.35□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W LST8P41318 303 aa3.35□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W SCP1Q08873 200 aa3.35□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YPR013CQ12145 317 aa3.35□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W SRL3P36167 246 aa3.34□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YFR035CP43608 114 aa3.34□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W YGL258W-AQ3E740 77 aa3.34□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W TAR1Q8TGM6 124 aa3.34□□□□□ -1.87
YHR140WYHR140W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W MRS4P23500 304 aa3.32□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W YPT31P38555 223 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W RAD6P06104 172 aa3.31□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W YBR219CP38317 127 aa3.31□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W POR2P40478 281 aa3.31□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W EST3Q03096 181 aa3.31□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W FPR2P32472 135 aa3.3□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W ATP5P09457 212 aa3.29□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W MRP17P28778 131 aa3.29□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W YBL071CP38185 102 aa3.29□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W HPA3P39979 161 aa3.29□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W COX12Q01519 83 aa3.29□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W COX8P04039 78 aa3.28□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W YER135CP40082 130 aa3.28□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W MOG1P47123 218 aa3.28□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W FIT2Q08906 153 aa3.28□□□□□ -1.88
YHR140WYHR140W SPT14P32363 452 aa3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W SNF11P38956 169 aa3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W THG1P53215 237 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W DAD4P69851 72 aa3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W FRQ1Q06389 190 aa3.27□□□□□ -1.89
YHR140WYHR140W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.6 ms