RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	DNF2	Q12675	1612 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	VMR1	P38735	1592 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	ANB1	P19211	157 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	BRP1	P53194	125 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	TLG1	Q03322	224 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RAV2	Q03956	351 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	RAF1	Q06891	181 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	YOR093C	Q12275	1648 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	IML1	P47170	1584 aa		0.15	□□□□□ -2.38
RSM27	YGR215W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TRA1	P38811	3744 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	BUD3	P25558	1636 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	RTC6	O14464	93 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	PET54	P10834	293 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YGL149W	P53116	101 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	DYN1	P36022	4092 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	FLO1	P32768	1537 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	ULS1	Q08562	1619 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	PFY1	P07274	126 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SRX1	P36077	127 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	MOG1	P47123	218 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SPO14	P36126	1683 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	NTE1	Q04958	1679 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	BPH1	P25356	2167 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	GSC2	P40989	1895 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	RAD50	P12753	1312 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	GCN2	P15442	1659 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	DNF3	Q12674	1656 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	MRPL44	P19956	98 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	QCR10	P37299	77 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YIL086C	P40503	102 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SPG1	P50088	95 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YDR366C	P87287	132 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	GTT2	Q12390	233 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	ESP1	Q03018	1630 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YBT1	P32386	1661 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	BLM10	P43583	2143 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	CCW14	O13547	238 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	AUA1	P32450	94 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	RPS27B	P38711	82 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	AIM18	P38884	321 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YIR020C	P40575	100 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	SWC7	Q06707	132 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	OCA6	Q12454	224 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	NUP192	P47054	1683 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-C	P25384	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	MLP2	P40457	1679 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	DOP1	Q03921	1698 aa		0.09	□□□□□ -2.39
RSM27	YGR215W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YCR050C	P25630	102 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	CYC2	P38909	366 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YAL064W	P39711	94 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	POR2	P40478	281 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	GAT4	P40569	121 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	SPC3	Q12133	184 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RTR2	Q12378	196 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	FIG2	P25653	1609 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		0.09	□□□□□ -2.4

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