RNA–Protein interactions for RNA: YGR163W

GTR2, Transcript of Putative GTP binding protein, yeast

Gene GTR2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR2	YGR163W	YHR130C	P38834	111 aa		0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	RPB11	P38902	120 aa		0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	PHS1	P40857	217 aa		0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YGR164W	P53291	111 aa		0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	ELC1	Q03071	99 aa		0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	ANB1	P19211	157 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YCR050C	P25630	102 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	PAM16	P42949	149 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YFR035C	P43608	114 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	EMC4	P53073	190 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	ERV14	P53173	138 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	PDR11	P40550	1411 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	PDR10	P51533	1564 aa		0.95	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	UBC4	P15731	148 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	FUN14	P18411	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	MRPL44	P19956	98 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YAL064W	P39711	94 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	LST8	P41318	303 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	MGR2	Q02889	113 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	SWC7	Q06707	132 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	FIT3	Q08907	204 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	MED11	Q99278	115 aa		0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YCR099C	P25657	155 aa		0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	SRB6	P32570	121 aa		0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		0.93	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.92	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.92	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.92	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.92	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.92	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	CAT8	P39113	1433 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	RTC6	O14464	93 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	QCR10	P37299	77 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	CWP2	P43497	92 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YGL149W	P53116	101 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	BRP1	P53194	125 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	RAF1	Q06891	181 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	SCC2	Q04002	1493 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	SWR1	Q05471	1514 aa		0.9	□□□□□ -2.26
GTR2	YGR163W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	ECM12	O13529	151 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	PAU2	P32612	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YKL044W	P36092	106 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	SPG1	P50088	95 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	PAU12	P53343	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	NUP159	P40477	1460 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	BNI1	P41832	1953 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YCR085W	P25650	117 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	SNF11	P38956	169 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	YER187W	P40102	141 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	CYB5	P40312	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
GTR2	YGR163W	EMC5	P40540	141 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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