RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	AHT1	P29589	182 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	SWD3	P38123	315 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	MIM1	Q08176	113 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YEL028W	P39989	153 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	BRP1	P53194	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	NDD1	Q08887	554 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	ERG4	P25340	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	CDC1	P40986	491 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YCR025C	P25352	136 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YKL044W	P36092	106 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	Q0255	P03881	472 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YFL019C	P43576	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	COA2	Q3E823	68 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	AIM26	P32858	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	VPS25	P47142	202 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	MIX14	Q04341	121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	FPR2	P32472	135 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	CSE2	P33308	149 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	MET31	Q03081	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YGL034C	P53186	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	MET32	Q12041	191 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	IMP1	P28627	190 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	APS1	P35181	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YER187W	P40102	141 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YNL217W	P40152	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	CRH1	P53301	507 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	DSE2	P38844	325 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	KEG1	P43614	200 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	PGU1	P47180	361 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	PIR1	Q03178	341 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CYK3	YDL117W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
CYK3	YDL117W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YFR035C	P43608	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	TIM12	P32830	109 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YIA6	P40556	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YGR045C	P53229	120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	UBC13	P52490	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YGL193C	P53097	103 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YGL088W	P53151	121 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	DSS4	P32601	143 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	SIM1	P40472	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	ICY1	Q04329	127 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	USV1	Q12132	391 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	MRP10	O75012	95 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YSY6	P38374	65 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	FHN1	P53279	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YKR045C	P36138	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YIL163C	P40448	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	ICS3	P47034	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	NRM1	P53718	249 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	STT4	P37297	1900 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	SPS100	P13130	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RPB9	P27999	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	SWS2	P53937	143 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	FLO1	P32768	1537 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	QCR9	P22289	66 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	TDA2	P40045	126 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	SPG4	Q04438	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RSM18	P40033	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	LST8	P41318	303 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	JJJ3	P47138	172 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YPR096C	O13587	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YKL097C	P34245	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YPS5	P53057	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	IRC23	Q08416	157 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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