RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C FZF1P32805 299 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C AME1P38313 324 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C VMA21P41806 77 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C DAN1P47178 298 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C FYV6P53913 173 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C ATP19P81451 68 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YDR274CP87283 123 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YMR244WQ04018 355 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C RRG8Q06109 277 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C NAT3Q06504 195 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C GEP3Q08622 556 aa4.33□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C FMP49A0A023PZB3 126 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MRPL4P36517 319 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YPT10P38146 199 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YER135CP40082 130 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C PAU15P40585 124 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YGL185CP53100 379 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C ALG13P53178 202 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C HHO1P53551 258 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C DAD4P69851 72 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C CCW12Q12127 133 aa4.32□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C POF1P25576 258 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C QRI5P32344 111 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C SDH4P37298 181 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YHR022CP38763 256 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MIG3P39943 394 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C PGD1P40356 397 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C TRI1Q05024 226 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C DCN1Q12395 269 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YOP1Q12402 180 aa4.31□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YBR013CP38215 129 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C HSP10P38910 106 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YFR035CP43608 114 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C HAM1P47119 197 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MGA1P53050 456 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MRPS8Q03799 155 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YLR342W-AQ3E810 57 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YCL001W-BQ96VH2 84 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YOL085CQ99345 113 aa4.3□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C CPT1P17898 393 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MIX23P38162 196 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YFR045WP43617 309 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YJR096WP47137 282 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YDL183CP48569 320 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YOR105WQ08504 108 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YPL162CQ12042 273 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YPR063CQ12160 140 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C DAD1Q12248 94 aa4.29□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C VAR1P02381 398 aa4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YGL010WP25338 174 aa4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C AUA1P32450 94 aa4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C NSE4P43124 402 aa4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C MOG1P47123 218 aa4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C YLR281CQ05863 155 aa4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RRP4YHR069C CUP2P15315 225 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C PAM17P36147 197 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C NRG2P38082 220 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C PAU5P43575 122 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C APS2Q00381 147 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C GIM5Q04493 163 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C MSC3Q05812 728 aa4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C UTP23Q12339 254 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPL12BP0CX54 165 aa4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C HMRA1P0CY11 126 aa4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C GET2P40056 285 aa4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C YML108WQ03759 105 aa4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C YNR034W-AQ3E841 98 aa4.26□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C VMA16P23968 213 aa4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C AGA1P32323 725 aa4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C DAD2P36162 133 aa4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C GTT1P40582 234 aa4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C COX12Q01519 83 aa4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C TIM22Q12328 207 aa4.25□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C PAU19P0CE85 124 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C PAU21P0CE86 164 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C PAU22P0CE87 164 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C PAU3P25610 124 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPB11P38902 120 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C VHS2P40463 436 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C UPS3Q04006 179 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C ZEO1Q08245 113 aa4.24□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C COX16P47081 118 aa4.23□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C UBC11P52492 156 aa4.23□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C DUO1P53168 247 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C YGR026WP53217 278 aa4.23□□□□□ -1.73
RRP4YHR069C YBR200W-AQ3E755 54 aa4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 108.5 ms