RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A VMA11P32842 164 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A PRS4P38063 326 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SOL1P50278 321 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ARO8P53090 500 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YNR064CP53750 290 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YNL046WP53956 172 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.14□□□□□ -2.07not detected
YLR347W-AYLR347W-A THI74Q04083 370 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A RIM9Q04734 239 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YOR385WQ08909 290 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A FCY1Q12178 158 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A MED4Q12343 284 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A DGK1Q12382 290 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YLR365WQ7LIF2 110 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A PET20Q99373 253 aa2.14□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A RNA15P25299 296 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YCR101CP25607 182 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YCR016WP25617 290 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A MRP17P28778 131 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YER137CP40083 148 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A OST2P46964 130 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YJR111CP47148 283 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A DAN1P47178 298 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A GEP7P53171 287 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YPL067CQ02754 198 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A VPS28Q02767 242 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A UPS1Q05776 175 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SCP1Q08873 200 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A EMC6Q12431 108 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YGL194C-AQ2V2P6 80 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YOS1Q3E834 85 aa2.13□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ARG80P07249 177 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A GCN3P14741 305 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A APA2P22108 325 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SCM4P32564 187 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YUH1P35127 236 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SRY1P36007 326 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A VMA22P38784 181 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2.12□□□□□ -2.07not detected
YLR347W-AYLR347W-A RFC2P40348 353 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A TTI2P47168 421 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A GIM3P53900 129 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A PLP1Q04004 230 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A COA4Q05809 96 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A RRT7Q07829 113 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ATO3Q12359 275 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A BBP1Q12365 385 aa2.12□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A CKS1P20486 150 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ROX3P25046 220 aa2.11□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A CPR5P35176 225 aa2.11□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YJR056CP47115 236 aa2.11□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SPG4Q04438 115 aa2.11□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A CSM4Q08955 156 aa2.11□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A QCR2P07257 368 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A PUT1P09368 476 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A URA5P13298 226 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YKR045CP36138 183 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SRL3P36167 246 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A IKI1P38874 309 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A LSM1P47017 172 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A SNX4P47057 423 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A JAC1P53193 184 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A LPP1Q04396 274 aa2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A CCW14O13547 238 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A RPL9AP05738 191 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A MAG1P22134 296 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A NRG2P38082 220 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ERV15P38312 142 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YEA6P39953 335 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A BMT5P40493 336 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A RPL9BP51401 191 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A MRPL50P53724 139 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A DID2P69771 204 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A DYN2Q02647 92 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A ARR2Q06597 130 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YPD1Q07688 167 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A PAM18Q07914 168 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YCT1Q12235 531 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YLR146W-AQ2V2P1 62 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A COA2Q3E823 68 aa2.09□□□□□ -2.07
YLR347W-AYLR347W-A YMR31P19955 123 aa2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.08□□□□□ -2.08not detected
YLR347W-AYLR347W-A YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A EST3Q03096 181 aa2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A HRD1Q08109 551 aa2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A IRC23Q08416 157 aa2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A YNG1Q08465 219 aa2.08□□□□□ -2.08
YLR347W-AYLR347W-A FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms