RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR213W	YHR213W	RMD6	P39975	231 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YFL051C	P43552	160 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	CCC1	P47818	322 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MRH4	P53166	561 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	PAU12	P53343	120 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	AIM34	Q03673	198 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	AIM36	Q03798	255 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	RAV2	Q03956	351 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	FIT3	Q08907	204 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YPS3	Q12303	508 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MRS1	P07266	363 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SPS100	P13130	326 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	AHC2	P25649	128 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	CLB6	P32943	380 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	APS1	P35181	156 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	PAU24	P38155	120 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	POP8	P38208	133 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	NVJ1	P38881	321 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	AVT6	P40074	448 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	AAH1	P53909	347 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YDR391C	Q04170	232 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SDH7	Q04401	133 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	GAL83	Q04739	417 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	FRQ1	Q06389	190 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	PRM7	Q12459	698 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	COX9	P07255	59 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YKR041W	P36134	250 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	FRM2	P37261	193 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YER076C	P40049	302 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	DLS1	P40366	167 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	TIR3	P40552	269 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	TOS8	P53147	276 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YGL034C	P53186	121 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	GPI17	Q04080	534 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	RFU1	Q08003	200 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	IGO2	Q9P305	131 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YOR304C-A	O14468	76 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SIR2	P06700	562 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	FCY2	P17064	533 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MRPS28	P21771	286 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YCL042W	P25572	119 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	PAU2	P32612	120 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SRY1	P36007	326 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.18	□□□□□ -2.06	not detected
YHR213W	YHR213W	FMP23	P38231	175 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	FLX1	P40464	311 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	XPT1	P47165	209 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	UBC12	P52491	188 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YNL184C	P53876	108 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SED1	Q01589	338 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YOR186W	Q08560	144 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.18	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	COX5B	P00425	151 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SGA1	P08019	549 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	CUP2	P15315	225 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SNC2	P33328	115 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SFK1	P35735	353 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	MBA1	P38300	278 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YHL044W	P38727	235 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	VMA7	P39111	118 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	GLE2	P40066	365 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	PAM16	P42949	149 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SDS23	P53172	527 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YNL046W	P53956	172 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	HHT1	P61830	136 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	UBC7	Q02159	165 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YKR005C	Q02203	525 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	YPL067C	Q02754	198 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	ARL3	Q02804	198 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SHH4	Q06236	168 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	IES3	Q12345	250 aa		2.17	□□□□□ -2.06
YHR213W	YHR213W	SLO1	Q3E784	85 aa		2.17	□□□□□ -2.06

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.6 ms