RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	LST8	P41318	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	YGR151C	P53287	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	FYV6	P53913	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	FCY1	Q12178	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	GET2	P40056	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	YJL213W	P40896	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	SBH2	P52871	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	LOA1	Q06508	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	MCH1	Q07376	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	CSI2	Q08054	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	APA2	P22108	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	YIL163C	P40448	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	MGA1	P53050	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	STD1	Q02794	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	ATC1	Q04005	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	LDS2	Q08218	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	JID1	Q12350	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YCK1	YHR135C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
YCK1	YHR135C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	PHD1	P36093	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YIR020C	P40575	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	ATG27	P46989	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YGR018C	P53211	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	LST7	P53237	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	DXO1	Q06349	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	ARR2	Q06597	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	STP4	Q07351	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YCR022C	P25620	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	SDH8	P38345	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YAR068W	P39564	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	BDH1	P39714	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	DAD3	P69850	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	NAT3	Q06504	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	HMX1	P32339	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YBL071C	P38185	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	CDS1	P38221	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	HUA1	P40325	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YIP1	P53039	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	IRC23	Q08416	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	GEP5	Q12393	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	LAS17	Q12446	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	TCA17	P32613	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	VMA11	P32842	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YBR090C	P38253	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	CDC7	P06243	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	FPR2	P32472	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	CSH1	P38287	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	SAS2	P40963	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	PAU5	P43575	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YJL163C	P46996	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YLR302C	O13544	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YGL010W	P25338	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YPS1	P32329	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	AVT5	P38176	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YHL044W	P38727	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	DOG2	P38773	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	DOG1	P38774	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	HSP10	P38910	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	GPI2	P46961	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YGL185C	P53100	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	ARL3	Q02804	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RAV2	Q03956	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	FIT2	Q08906	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YOP1	Q12402	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	ACP1	P32463	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	SRP14	P38985	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	TOM7	P53507	60 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	RKI1	Q12189	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62

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