RNA–Protein interactions for RNA: YGR108W

CLB1, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB1	YGR108W	CPD1	P53314	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RIM9	Q04734	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RFU1	Q08003	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
CLB1	YGR108W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YCR007C	P25354	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	MCH2	P36032	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	TRM9	P49957	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	WSC2	P53832	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	LPP1	Q04396	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	ECM18	Q04623	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	CNL1	Q06333	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	HNT3	Q08702	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	FLO9	P39712	1322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	SAG1	P20840	650 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	UBS1	P38290	277 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	CIN5	P40917	295 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YJR015W	P47090	510 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	TDA4	P47153	279 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YNR071C	P53757	342 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	TRS23	Q03784	219 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	ATO3	Q12359	275 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB1	YGR108W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	IMP1	P28627	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	QRI5	P32344	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	LCL3	P53153	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	BOR1	P53838	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SWS2	P53937	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	DYN2	Q02647	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ATG40	Q99325	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	MRS3	P10566	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ZRT1	P32804	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	HUA1	P40325	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YIL086C	P40503	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YAP6	Q03935	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ATG39	Q06159	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	RKI1	Q12189	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	COX1	P00401	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	MRP49	P32388	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	PRM5	P40476	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	PCP1	P53259	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YHP1	Q04116	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	API2	Q04413	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	HRD1	Q08109	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	PAI3	P01094	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SRX1	P36077	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	PSD1	P39006	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	REE1	P40893	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YDL183C	P48569	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	MIC27	P50945	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SDS23	P53172	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	COX18	P53239	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ATG4	P53867	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	FAB1	P34756	2278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ATP10	P18496	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ROX3	P25046	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLB1	YGR108W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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