RNA–Protein interactions for RNA: YMR215W

GAS3, Transcript of Putative 1,3-beta-glucanosyltransferase, yeast

Gene GAS3, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAS3	YMR215W	YLR462W	O13556	202 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	ETR1	P38071	380 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	TIM17	P39515	158 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FIP1	P45976	327 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YGL230C	P53074	147 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	MIM1	Q08176	113 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	TRS20	P38334	175 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	PRM5	P40476	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YIL024C	P40543	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SNM1	P40993	198 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SDS23	P53172	527 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	BSC1	Q12140	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YPS3	Q12303	508 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	OCA6	Q12454	224 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	IMP1	P28627	190 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	GGC1	P38988	300 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YER181C	P40097	107 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SBH1	P52870	82 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	PIR3	Q03180	325 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FSH2	Q05015	223 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RNH202	Q05635	350 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	DGK1	Q12382	290 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	ATP5	P09457	212 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	LDS1	P31379	325 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SMP1	P38128	452 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YBR090C	P38253	122 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YHR140W	P38842	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	NSE4	P43124	402 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	TDA4	P47153	279 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RSM27	P53305	110 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	ADD37	Q03233	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	HUT1	Q12520	339 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FLO11	P08640	1367 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	LDB16	P25587	256 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	PEX4	P29340	183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	AVT2	P39981	480 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FIS1	P40515	155 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YJL213W	P40896	331 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FMP48	P53233	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
GAS3	YMR215W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	RPB11	P38902	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	GON7	P46984	123 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	DIE2	P50076	525 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	GTT2	Q12390	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	MRS3	P10566	314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YCR025C	P25352	136 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	CSE2	P33308	149 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	MIX23	P38162	196 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	PHO89	P38361	574 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	NSG1	P38837	291 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	GAS3	Q03655	524 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	LPP1	Q04396	274 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SCW10	Q04951	389 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FMP42	Q04991	504 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	SCP1	Q08873	200 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	FLO1	P32768	1537 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GAS3	YMR215W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	TAO3	P40468	2376 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	SPT14	P32363	452 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	BUD25	P85052	153 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	ELC1	Q03071	99 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	TVP18	Q04767	167 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	IZH2	Q12442	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	REP2	P03872	296 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	YCR022C	P25620	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	SKG1	P36169	355 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GAS3	YMR215W	IRC22	P40006	225 aa		4.2	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.4 ms