RNA–Protein interactions for RNA: YKR019C

IRS4, Transcript of EH domain-containing protein, yeast

Gene IRS4, Length 1,848 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRS4	YKR019C	IZH2	Q12442	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	LDB16	P25587	256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SPT14	P32363	452 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	ERV15	P38312	142 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	MTC6	P38849	526 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	GGC1	P38988	300 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	FIS1	P40515	155 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SNO3	P43544	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SNO2	P53823	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YCL001W-A	P87012	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SML1	Q04964	104 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
IRS4	YKR019C	YHR130C	P38834	111 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	AVT7	P40501	490 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	VPS25	P47142	202 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YGR015C	P53208	328 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YOR292C	Q08743	309 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	MCP1	Q12106	302 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	HAP1	P0CE41	1502 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	ATP5	P09457	212 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	TIM17	P39515	158 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	PRM5	P40476	318 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CSR2	Q12734	1121 aa		5	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	COX14	P39103	70 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YJL213W	P40896	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	DOC1	P53068	250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	WSC2	P53832	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	BUD25	P85052	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CCH1	P50077	2039 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SNF2	P22082	1703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	UBC5	P15732	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	TDA4	P47153	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SCW10	Q04951	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SCM4	P32564	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	GAA1	P39012	614 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	AVT2	P39981	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	UIP4	Q08926	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	MRS3	P10566	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YCR025C	P25352	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CSE2	P33308	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CHS7	P38843	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	UPS1	Q05776	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SMP1	P38128	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	RAD10	P06838	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	URA10	P30402	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SDH4	P37298	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	IRC22	P40006	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SPC25	P40014	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SNM1	P40993	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SDS23	P53172	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	EAF6	P47128	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	GEP7	P53171	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	GAS3	Q03655	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	SGA1	P08019	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	MRPL44	P19956	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	AHT1	P29589	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	MOH1	P38191	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	NSG1	P38837	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YAR029W	P39549	74 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	YER188W	P40103	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRS4	YKR019C	ATG10	Q07879	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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