RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A SHH3Q04487 196 aa0.86□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YOR214CQ12282 236 aa0.86□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YLR236CA0A023PZG4 107 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RPL30P14120 105 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YCR023CP25351 611 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A HSP30P25619 332 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A TFC1P32367 649 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A PTC1P35182 281 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A PAM17P36147 197 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YHR022CP38763 256 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A DSE2P38844 325 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A NSA2P40078 261 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A AGE2P40529 298 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A APQ12P40532 138 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A SOL1P50278 321 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A NQM1P53228 333 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A MPC3P53311 146 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A PKR1Q03880 122 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RAV2Q03956 351 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A THI74Q04083 370 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YDR391CQ04170 232 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YMR253CQ04835 414 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A NAT3Q06504 195 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YPD1Q07688 167 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A HRD1Q08109 551 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A IRC23Q08416 157 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YPR202WQ08993 238 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A DAS2Q12084 232 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YLR046CQ12253 270 aa0.85□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RAD6P06104 172 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A ATP5P09457 212 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A DDI2P0CH63 225 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A DDI3P0CH64 225 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A TIR1P10863 254 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A IDP1P21954 428 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A MDH2P22133 377 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A POP7P38291 140 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YBR220CP38318 560 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A GAA1P39012 614 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A SPC25P40014 221 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YER135CP40082 130 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RIO2P40160 425 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A DLS1P40366 167 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A MOG1P47123 218 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YGL193CP53097 103 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YNL033WP53964 284 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A YDC1Q02896 317 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A PIR1Q03178 341 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A GAL83Q04739 417 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A SML1Q04964 104 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A ANT1Q06497 328 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A SYM1Q06563 197 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A RAD28Q12021 506 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A BOL1Q3E793 110 aa0.84□□□□□ -2.27
YHL009W-AYHL009W-A SPA2P23201 1466 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A SEC11P15367 167 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A GSP2P32836 220 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A TMA19P35691 167 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A SFK1P35735 353 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A CSH1P38287 376 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A FYV4P38783 130 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A IPI1P38803 334 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YPL073CP40323 161 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A PEP8P40335 379 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YJR015WP47090 510 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YGL204CP53089 101 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A ORM1P53224 222 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YGR042WP53227 271 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A HHO1P53551 258 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A BUD25P85052 153 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A UPS3Q04006 179 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YOR015WQ12169 119 aa0.83□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A PHO85P17157 305 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A UPS2P35200 230 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A RRT1P38192 103 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YEL028WP39989 153 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YNL200CP40165 246 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A MOB1P40484 314 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YGR201CP42936 225 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A CCC1P47818 322 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A KNH1P50112 268 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YNR064CP53750 290 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A LIP1Q03579 150 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A SPC2Q04969 178 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YHR007C-AQ07074 71 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A FYV12Q08559 129 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A UIP4Q08926 304 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A YPR013CQ12145 317 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A ATP20Q12233 115 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A FLO9P39712 1322 aa0.82□□□□□ -2.28
YHL009W-AYHL009W-A STF2P16965 84 aa0.81□□□□□ -2.28
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