RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
NTF2YER009W NSA2P40078 261 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
NTF2YER009W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
NTF2YER009W UPS3Q04006 179 aa1.15□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YLR422WQ06409 1932 aa1.15□□□□□ -2.23
NTF2YER009W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YCR023CP25351 611 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W ATP7P30902 174 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W SBH1P52870 82 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W GIM3P53900 129 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YMR007WQ03675 126 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W SHH4Q06236 168 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YET3Q07451 203 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W ATP20Q12233 115 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W DGK1Q12382 290 aa1.14□□□□□ -2.23
NTF2YER009W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data1.13□□□□□ -2.23not detected
NTF2YER009W STP22P25604 385 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YKL102CP34249 101 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YKR041WP36134 250 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W HUA1P40325 198 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YLR460CP54007 376 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W DAS2Q12084 232 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W PST2Q12335 198 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W COA3Q3E7B2 85 aa1.13□□□□□ -2.23
NTF2YER009W PIR1Q03178 341 aa1.12□□□□□ -2.23
NTF2YER009W GPI17Q04080 534 aa1.12□□□□□ -2.23
NTF2YER009W GAL83Q04739 417 aa1.12□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YOR015WQ12169 119 aa1.12□□□□□ -2.23
NTF2YER009W RRT1P38192 103 aa1.11□□□□□ -2.23
NTF2YER009W NVJ1P38881 321 aa1.11□□□□□ -2.23
NTF2YER009W RFC2P40348 353 aa1.11□□□□□ -2.23
NTF2YER009W MET31Q03081 177 aa1.11□□□□□ -2.23
NTF2YER009W STF2P16965 84 aa1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W SEC14P24280 304 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W CLG1P35190 452 aa1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W MPM1P40364 252 aa1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W POG1P40473 351 aa1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YGL235WP53071 178 aa1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W GRE1Q08969 168 aa1.1□□□□□ -2.23
NTF2YER009W SEN2P16658 377 aa1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W SEC72P39742 193 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W NSE4P43124 402 aa1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W DML1Q03652 475 aa1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W YDR391CQ04170 232 aa1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W UPS1Q05776 175 aa1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W TAR1Q8TGM6 124 aa1.09□□□□□ -2.23
NTF2YER009W HSP30P25619 332 aa1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W TRR1P29509 319 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W CPR5P35176 225 aa1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W VPS28Q02767 242 aa1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W GRX5Q02784 150 aa1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YHP1Q04116 353 aa1.08□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YBL010CP32788 280 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W MRPL15P36523 253 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YBR242WP38331 238 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W SOL1P50278 321 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W JAC1P53193 184 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W ATG41Q12048 136 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YOR214CQ12282 236 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YOR381W-AQ3E804 55 aa1.07□□□□□ -2.24
NTF2YER009W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W UBC8P28263 218 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W TTI2P47168 421 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YIP3P53633 176 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YKR005CQ02203 525 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W RIM9Q04734 239 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W ELP6Q04868 273 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YPR127WQ06494 345 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W PEX11Q12462 236 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YMR030W-AQ3E760 96 aa1.06□□□□□ -2.24
NTF2YER009W MAK31P23059 88 aa1.05□□□□□ -2.24
NTF2YER009W ETR1P38071 380 aa1.05□□□□□ -2.24
NTF2YER009W CCS1P40202 249 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
NTF2YER009W SBH2P52871 88 aa1.05□□□□□ -2.24
NTF2YER009W TIM13P53299 105 aa1.05□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YPR203WQ08994 102 aa1.05□□□□□ -2.24
NTF2YER009W AHT1P29589 182 aa1.04□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data1.04□□□□□ -2.24not detected
NTF2YER009W EGD2P38879 174 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
NTF2YER009W SRP14P38985 146 aa1.04□□□□□ -2.24
NTF2YER009W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
NTF2YER009W YHL037CP38733 133 aa1.03□□□□□ -2.24
NTF2YER009W XPT1P47165 209 aa1.03□□□□□ -2.24
NTF2YER009W LCL2Q08045 131 aa1.03□□□□□ -2.24
NTF2YER009W RAD6P06104 172 aa1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W YER188C-AP0C0V2 99 aa1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W RAD51P25454 400 aa1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W CSH1P38287 376 aa1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W HHT1P61830 136 aa1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W PLP1Q04004 230 aa1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
NTF2YER009W GLR1P41921 483 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
NTF2YER009W YFL051CP43552 160 aa1.01□□□□□ -2.25
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