RNA–Protein interactions for RNA: YDL007W

RPT2, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT2, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT2	YDL007W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YBR220C	P38318	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	ELO1	P39540	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	COQ11	Q05892	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	NAT3	Q06504	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	NUP1	P20676	1076 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	PPA2	P28239	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YHL044W	P38727	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	TEM1	P38987	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YIL169C	P40442	995 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	ZIM17	P42844	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	BRR6	P53062	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YGL230C	P53074	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	HRD1	Q08109	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	BSC6	Q08280	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YLR302C	O13544	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	PAI3	P01094	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YCR007C	P25354	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	GPX1	P36014	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YPT53	P36019	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	SRX1	P36077	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	FRM2	P37261	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	PFS1	P38872	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	RPA43	P46669	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	GPI2	P46961	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	SAM50	P53969	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	SEI1	Q06058	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	CNL1	Q06333	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	LOA1	Q06508	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	PFA4	Q12006	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	ISA2	Q12425	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPT2	YDL007W	SEC11	P15367	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	ANB1	P19211	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	DAL80	P26343	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	ERV1	P27882	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	MRP49	P32388	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	REC114	P32841	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	UBS1	P38290	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	POP2	P39008	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YAL037W	P39728	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	HAC1	P41546	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	XPT1	P47165	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	MSY1	P48527	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YGR126W	P53274	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	CRH1	P53301	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	PDR17	P53844	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	TRS23	Q03784	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	SNA4	Q07549	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	RKI1	Q12189	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	PAM17	P36147	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	QDR3	P38227	689 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	TAE1	P38340	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	SRP14	P38985	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	PSD1	P39006	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YND1	P40009	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YNL198C	P40166	100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YGR269W	P40326	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	DIA1	P54005	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	MCH4	Q08268	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	VPS68	Q12016	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	IMG1	P25626	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	OCH1	P31755	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	EMP70	P32802	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	ATF1	P40353	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	TSA2	Q04120	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	SCW10	Q04951	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	POS5	Q06892	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	LDS2	Q08218	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	RLM1	Q12224	676 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPT2	YDL007W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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