RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	TPO4	Q12256	659 aa		0.82	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.82	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CDC7	P06243	507 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PTM1	P32857	523 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YET1	P35723	206 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CTR2	P38865	189 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YHR180W	P38868	163 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PEX17	P40155	199 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	BLM10	P43583	2143 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	GAS3	Q03655	524 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	SML1	Q04964	104 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	JLP1	Q12358	412 aa		0.81	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	DBF2	P22204	572 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	SNC2	P33328	115 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	POP4	P38336	279 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	AVT2	P39981	480 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	GLE2	P40066	365 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RSM25	P40496	264 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RPA43	P46669	326 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	NUP57	P48837	541 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	BRR6	P53062	197 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	TOS8	P53147	276 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PRM8	P53174	237 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	MDM32	Q12171	622 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PDR18	P53756	1333 aa		0.8	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	BPH1	P25356	2167 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	SPT3	P06844	337 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	QCR8	P08525	94 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	GCN3	P14741	305 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.79	□□□□□ -2.28	not detected
HIT1	YJR055W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	TRM5	P38793	499 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	ICE2	P40499	491 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RPC17	P47076	161 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YJR149W	P47177	404 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	MIC26	P50087	233 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CSI2	Q08054	341 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	GPM2	Q12008	311 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PSF1	Q12488	208 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.79	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	CCW14	O13547	238 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	MAK31	P23059	88 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PBN1	P25580	416 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	MEI4	P29467	408 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	FZF1	P32805	299 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	APS1	P35181	156 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	IRC22	P40006	225 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	FAR7	P43592	221 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	RAD17	P48581	401 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	BNA7	Q04066	261 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	SEY1	Q99287	776 aa		0.78	□□□□□ -2.28
HIT1	YJR055W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	TIM9	O74700	87 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	KSS1	P14681	368 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	RPO26	P20435	155 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	BET1	P22804	142 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YKL102C	P34249	101 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	UMP1	P38293	148 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YBR209W	P38311	105 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SVP26	P38869	228 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GAA1	P39012	614 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	ERG28	P40030	148 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YNL194C	P40169	301 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	IRC18	P47056	224 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	EMC4	P53073	190 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	DID2	P69771	204 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YDR274C	P87283	123 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	SWP1	Q02795	286 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	TRM12	Q04235	462 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	ATG10	Q07879	167 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YPL162C	Q12042	273 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.77	□□□□□ -2.29
HIT1	YJR055W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.77	□□□□□ -2.29

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