RNA–Protein interactions for RNA: YJL117W

PHO86, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) resident protein, yeast

Gene PHO86, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO86	YJL117W	HLR1	Q04429	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	RAD6	P06104	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	FUB1	P25659	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YKL102C	P34249	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	SPL2	P38839	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	SPO73	P40031	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	WSC2	P53832	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	AIM11	P87275	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	CDC14	Q00684	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	IRC15	Q02733	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	EST3	Q03096	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	GAS3	Q03655	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	RXT3	Q07458	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YFH1	Q07540	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	COX19	Q3E731	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PHO85	P17157	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YCR099C	P25657	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	EMC3	P36039	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	NDT80	P38830	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PAM16	P42949	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YFR020W	P43600	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	LCB3	P47013	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YDL186W	P48568	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	SBH1	P52870	82 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	IZH1	Q03419	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ATG41	Q12048	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	BET2	P20133	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ERG8	P24521	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	CDC5	P32562	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	REC104	P33323	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	SKN1	P33336	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PAU16	P35994	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	CMC1	P36064	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ATX1	P38636	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	TEM1	P38987	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	APQ12	P40532	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	GRX8	Q05926	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	UBA3	Q99344	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PDE1	P22434	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	XBP1	P40489	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	HMS2	P47175	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YGL262W	P53054	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YIP5	P53108	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	BET5	Q03630	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	KEI1	Q06346	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ARR3	Q06598	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	RPB8	P20436	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	MAK32	P23060	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ATS1	P31386	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	SRP21	P32342	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
PHO86	YJL117W	YKR041W	P36134	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YND1	P40009	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YIR016W	P40572	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PHS1	P40857	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YJL213W	P40896	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	CWP2	P43497	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YFL012W	P43580	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YFR045W	P43617	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YGR039W	P53225	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	JID1	Q12350	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	ICT1	Q12385	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PHO86	YJL117W	MSI1	P13712	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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