RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	ARG80	P07249	177 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
SEC27	YGL137W	BNA6	P43619	295 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	TAD2	P47058	250 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	UFD1	P53044	361 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	CGR1	P53188	120 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	GPI17	Q04080	534 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YPR127W	Q06494	345 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MCP1	Q12106	302 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	PPA2	P28239	310 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
SEC27	YGL137W	JEN1	P36035	616 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YBR063C	P38083	404 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YHR180W	P38868	163 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YDR209C	Q03480	137 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MDM32	Q12171	622 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MAL32	P38158	584 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	BRR6	P53062	197 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MAL12	P53341	584 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	RTR2	Q12378	196 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	QRI5	P32344	111 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	CLG1	P35190	452 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MRPL3	P36516	390 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YGL101W	P53144	215 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	SAY1	P53324	424 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	ASI3	P53983	676 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	DCR2	Q05924	578 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	COQ10	Q08058	207 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	ATG5	Q12380	294 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	TFC7	Q12415	435 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	DOA4	P32571	926 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	FMC1	P40491	155 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	ECO1	P43605	281 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YMR166C	Q03829	368 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	COA4	Q05809	96 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YPD1	Q07688	167 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YPL229W	Q99395	206 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	PHO80	P20052	293 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	POP8	P38208	133 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	NVJ1	P38881	321 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	BDH1	P39714	382 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	AGE2	P40529	298 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	CIN5	P40917	295 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	MIX14	Q04341	121 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	GAL83	Q04739	417 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	NEJ1	Q06148	342 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YOS9	Q99220	542 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SEC27	YGL137W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	MDH2	P22133	377 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	MSN4	P33749	630 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YER085C	P40058	173 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YGL034C	P53186	121 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	RSM10	Q03201	203 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YDR102C	Q03864	110 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		2.59	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YCR102C	P25608	368 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	ECM31	P38122	312 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YIA6	P40556	373 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	MRH4	P53166	561 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	SIR2	P06700	562 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	STE18	P18852	110 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	VMA7	P39111	118 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	PET191	Q02772	108 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YDR249C	Q03787	373 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	GTO3	Q04806	366 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	PAM18	Q07914	168 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SEC27	YGL137W	MNN5	P46982	586 aa		2.57	□□□□□ -2

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