RNA–Protein interactions for RNA: YFR009W

GCN20, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN20, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN20	YFR009W	CDC50	P25656	391 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	DAL3	P32459	195 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	PCL7	P40186	285 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	PAU5	P43575	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	TAF4	P50105	388 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YIP5	P53108	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YGR050C	P53231	118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ATG4	P53867	494 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ARL3	Q02804	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	MRPS5	P33759	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YKL107W	P34251	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YGR269W	P40326	108 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YGL185C	P53100	379 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	LIP2	Q06005	328 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	FIT3	Q08907	204 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	COA6	Q3E846	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YMR31	P19955	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	AFR1	P33304	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	MRPL28	P36527	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	IRC22	P40006	225 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	GET2	P40056	285 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YER084W	P40057	128 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	TAX4	P47030	604 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	APS2	Q00381	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ERV2	Q12284	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	FCY2	P17064	533 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RTG1	P32607	177 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	PSD1	P39006	500 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ATG27	P46989	271 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ERV14	P53173	138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YAP1802	P53309	568 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	HCH1	P53834	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	HSK3	P69852	69 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RAF1	Q06891	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YPS3	Q12303	508 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	VPS63	O13549	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ROX3	P25046	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	LDB16	P25587	256 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YBL059W	P34224	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	PTC7	P38797	343 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	MTC6	P38849	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	YNR040W	P53736	256 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	DMA2	P53924	522 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	CYT2	Q00873	224 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	DAL4	Q04895	635 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	BLM10	P43583	2143 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GCN20	YFR009W	STE4	P18851	423 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	SEC62	P21825	274 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	ATG15	P25641	520 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	COQ3	P27680	312 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	YKL075C	P36083	450 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	XPT1	P47165	209 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	SIP18	P50263	79 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	DAD3	P69850	94 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	YOX1	P34161	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	CPR5	P35176	225 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	QDR3	P38227	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	WSC2	P53832	503 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	LPP1	Q04396	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	YMR262W	P38430	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	CYB5	P40312	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	GPI2	P46961	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	LST7	P53237	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	BOR1	P53838	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	OCA2	P53949	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	ECM18	Q04623	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	TMA17	Q12513	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	RIP1	P08067	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	REC104	P33323	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	ATC1	Q04005	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCN20	YFR009W	ARR3	Q06598	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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