RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C LSM4P40070 187 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PRM5P40476 318 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BMT5P40493 336 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YGL262WP53054 175 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C WSC2P53832 503 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C HSK3P69852 69 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MRPS16Q02608 121 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CAB5Q03941 241 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C THI74Q04083 370 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TSA2Q04120 196 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C VBA1Q04301 562 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ECM18Q04623 453 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RIM9Q04734 239 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C IRC25Q07951 179 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CSI2Q08054 341 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YDL009CQ12210 107 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOR029WQ12243 111 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SCM3Q12334 223 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TFC7Q12415 435 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ARG80P07249 177 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C QCR2P07257 368 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C GRX2P17695 143 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C OLE1P21147 510 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MRP17P28778 131 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TRR1P29509 319 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C VMA8P32610 256 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TCA17P32613 152 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C VMA11P32842 164 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PPQ1P32945 549 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CPR5P35176 225 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SOR1P35497 357 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CUE1P38428 203 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SSO2P39926 295 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YGR210CP42942 411 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ABM1P47146 123 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TTI2P47168 421 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C NIF3P53081 288 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YGL114WP53134 725 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CWC25P53854 179 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MEH1Q02205 184 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SOR2Q07786 357 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOR292CQ08743 309 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C FEX1Q08913 375 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C FEX2Q08991 375 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BBP1Q12365 385 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C DGK1Q12382 290 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PRM4Q12498 284 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C HUG1Q6Q5K6 68 aa1.8□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C IRA1P18963 3092 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TPI1P00942 248 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PUT1P09368 476 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C GCN3P14741 305 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ERG2P32352 222 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MRP20P32387 263 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SUA5P32579 426 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YNK1P36010 153 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ADH5P38113 351 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C LAG1P38703 411 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RRF1P38771 230 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C IKI1P38874 309 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data1.79□□□□□ -2.12not detected
GCN4YEL009C PSD1P39006 500 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PCL7P40186 285 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YIR035CP40579 254 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BNA1P47096 177 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MSO1P53604 210 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C LPP1Q04396 274 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ARR2Q06597 130 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YFH1Q07540 174 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOL029CQ08187 201 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCT1Q12235 531 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YER078W-AQ3E7A2 54 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BLM10P43583 2143 aa1.79□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BGL2P15703 313 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YMR31P19955 123 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CKS1P20486 150 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ROX3P25046 220 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPB9P27999 122 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ACB1P31787 87 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SPS18P32572 300 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PMU1P36069 295 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SRL3P36167 246 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YPC1P38298 316 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ERV15P38312 142 aa1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YER137CP40083 148 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.3 ms