RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YJL118W	P47022	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ERG25	P53045	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ORM1	P53224	222 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YNR064C	P53750	290 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	DID2	P69771	204 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	HSK3	P69852	69 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SED1	Q01589	338 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YPD1	Q07688	167 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GAT3	Q07928	141 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RNH203	Q12338	110 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	TFC7	Q12415	435 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	IES6	P32617	166 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SWD3	P38123	315 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	VMA7	P39111	118 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	UBP8	P50102	471 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	PKP2	P53170	491 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RIM9	Q04734	239 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
CPR4	YCR069W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	REP2	P03872	296 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YBR292C	P38357	123 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	ECM14	P38836	430 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	VPS28	Q02767	242 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	LPP1	Q04396	274 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	TOR1	P35169	2470 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	NUM1	Q00402	2748 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CPR4	YCR069W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ROX3	P25046	220 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ERV1	P27882	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ERG2	P32352	222 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YEA6	P39953	335 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YEA4	P40004	342 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	PCL7	P40186	285 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YJR012C	P47087	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	JAC1	P53193	184 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YNR066C	P53752	436 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	CAF40	P53829	373 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	INN1	P53901	409 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	APJ1	P53940	528 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	TIM10	P87108	93 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	TSA2	Q04120	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	CAC2	Q04199	468 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YFH1	Q07540	174 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	IRC25	Q07951	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RAD28	Q12021	506 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RFM1	Q12192	310 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YPS3	Q12303	508 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	AGC1	Q12482	902 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ZRC1	P20107	442 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	FPR2	P32472	135 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YKL162C	P36052	402 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	FIG1	P38224	298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	PSD1	P39006	500 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SSO2	P39926	295 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	SPC25	P40014	221 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	AGX1	P43567	385 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YIP1	P53039	248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YGL114W	P53134	725 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CPR4	YCR069W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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