RNA–Protein interactions for RNA: YOR303W

CPA1, Transcript of Small subunit of carbamoyl phosphate synthetase, yeast

Gene CPA1, Length 1,236 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPA1	YOR303W	MSN2	P33748	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YHR033W	P38690	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YHR210C	P38893	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YEL076C	P39971	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YIL060W	P40519	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	CIN2	P46670	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PUS2	P53167	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	SUN4	P53616	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	SOR2	Q07786	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PLB3	Q08108	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	KTI11	Q3E840	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HIP1	P06775	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	CWP1	P28319	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	NTH1	P32356	751 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PEX2	P32800	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	SGE1	P33335	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ATX1	P38636	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	RPB11	P38902	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YER076C	P40049	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PRM5	P40476	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PHS1	P40857	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YHC3	P47040	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	CDH1	P53197	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	GAS3	Q03655	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	MSS11	Q03825	758 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	TRI1	Q05024	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	INM2	Q05533	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PFA4	Q12006	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HEM2	P05373	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PHO85	P17157	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	MKK2	P32491	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ASK1	P35734	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YIL059C	P40520	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	SBH1	P52870	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ERG25	P53045	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	DUG3	P53871	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	IBD2	P53892	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PGA1	P53896	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	POS5	Q06892	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	IZH2	Q12442	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HEM4	P06174	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	SCO1	P23833	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	TKL2	P33315	681 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YBR292C	P38357	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	AZF1	P41696	914 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YFL065C	P43539	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YFR045W	P43617	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	GON7	P46984	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ATG27	P46989	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	COQ5	P49017	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	TAM41	P53230	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	CRZ1	P53968	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ADD37	Q03233	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	TSA2	Q04120	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	LDS2	Q08218	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	GPB1	Q08886	897 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PRM3	Q08931	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	ATG41	Q12048	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	GAC1	P28006	793 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YAL037W	P39728	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	BNS1	P50084	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YNR048W	P53740	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YNL143C	P53908	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	UPS1	Q05776	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YFH1	Q07540	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	OPI10	Q08202	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	DCI1	Q08558	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPA1	YOR303W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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