RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	FIG1	P38224	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	YKE4	P40544	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	PIR5	P46999	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	DIE2	P50076	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	FIT1	Q04433	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	PRM4	Q12498	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	ATG22	P25568	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	FMT1	P32785	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	RPB7	P34087	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	PCL7	P40186	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	YGL114W	P53134	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	CAB5	Q03941	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PIN2	YOR104W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	LSB5	P25369	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	POP8	P38208	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	COS8	P38723	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	UBC11	P52492	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	VBA1	Q04301	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RIM9	Q04734	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	SYM1	Q06563	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	SEN2	P16658	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RPB9	P27999	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	MRP17	P28778	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	MRP20	P32387	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	SUA5	P32579	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	SRY1	P36007	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
PIN2	YOR104W	SSO2	P39926	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	TSA2	Q04120	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RTT103	Q05543	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YFH1	Q07540	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YPD1	Q07688	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	DIF1	O13577	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	AGA2	P32781	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	VMA11	P32842	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	IKI1	P38874	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	LPP1	Q04396	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	SWT1	Q12104	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	ARG80	P07249	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	QCR2	P07257	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	ECM31	P38122	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YER188W	P40103	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	WSC2	P53832	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	THI74	Q04083	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	PAM18	Q07914	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	HRD1	Q08109	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	TFC7	Q12415	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	PHO85	P17157	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	ERG2	P32352	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YIP1	P53039	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YGL262W	P53054	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YNG1	Q08465	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	BPH1	P25356	2167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	CCW14	O13547	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	PUT1	P09368	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	GCN3	P14741	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIN2	YOR104W	YMR31	P19955	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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