RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	POP2	P39008	433 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	ADD37	Q03233	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	IRC25	Q07951	179 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
YRF1-4	YLR466W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	CAF40	P53829	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RUB1	Q03919	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YKL162C	P36052	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SWD3	P38123	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SLM6	P38343	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	FRE8	Q12209	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	DGK1	Q12382	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ERG2	P32352	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	MRPL4	P36517	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	GEP7	P53171	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YAP1802	P53309	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	PDR17	P53844	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ECM18	Q04623	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	BPH1	P25356	2167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	UPS2	P35200	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YMR262W	P38430	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SEN34	P39707	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RFC2	P40348	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	EGT2	P42835	1041 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	XPT1	P47165	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	HSK3	P69852	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	HOF1	Q05080	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SPC25	P40014	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	PRM5	P40476	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	CIN5	P40917	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	BNA2	P47125	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TTI2	P47168	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	NRG1	Q03125	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	HRD1	Q08109	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	CDC7	P06243	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RFM1	Q12192	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	COX15	P40086	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SEC59	P20048	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SPO13	P23624	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	VMA3	P25515	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	CDS1	P38221	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	WSC2	P53832	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	MRPL22	P53881	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	EST3	Q03096	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	HED1	Q03937	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	COX19	Q3E731	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TOR1	P35169	2470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YGL262W	P53054	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ATG5	Q12380	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	AGA2	P32781	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	GTT1	P40582	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YAR1	P46683	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YNR064C	P53750	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	HHO1	P53551	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	DCS1	Q06151	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TDA6	Q06466	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	FCY2	P17064	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	MTC6	P38849	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YCK3	P39962	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YIP1	P53039	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YIP5	P53108	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	FSH2	Q05015	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YIL024C	P40543	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	SNO1	Q03144	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	ERF2	Q06551	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRF1-4	YLR466W	AIM29	P36154	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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