RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	YNR048W	P53740	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	APS2	Q00381	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RSM23	Q01163	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	GIS1	Q03833	894 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	FSH2	Q05015	223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ISA2	Q12425	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PEX4	P29340	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MTC7	P32633	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	UTH1	P36135	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPS27B	P38711	82 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HCH1	P53834	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SWS2	P53937	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HHT1	P61830	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	NRG1	Q03125	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATC1	Q04005	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATX2	Q12067	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATP5	P09457	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	QCR9	P22289	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SCO1	P23833	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	IMG1	P25626	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATG15	P25641	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ERV1	P27882	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RML2	P32611	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	REC114	P32841	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PTC7	P38797	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PFS1	P38872	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SPG5	P42933	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CTK2	P46962	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TAX4	P47030	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PDR17	P53844	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CTS2	Q06350	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YFT2	Q06676	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	FRE8	Q12209	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	OCH1	P31755	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ERG2	P32352	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	EMP70	P32802	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SEF1	P34228	1148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YUH1	P35127	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	UPS2	P35200	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SRX1	P36077	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RTS2	P40962	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YFR054C	P43622	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YGR126W	P53274	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	COQ11	Q05892	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	DIC1	Q06143	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PIN3	Q06449	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	GRE1	Q08969	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	PRR2	Q12310	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	HMS1	Q12398	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SEC62	P21825	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	WSC4	P38739	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YEL057C	P39983	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	GET2	P40056	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	RFC2	P40348	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YIL152W	P40455	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	YIL086C	P40503	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	GLC8	P41818	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	ATG27	P46989	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	TTI2	P47168	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	OST3	P48439	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR041W	YKR041W	MHR1	Q06630	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.5 ms