RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
PSH1	YOL054W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
PSH1	YOL054W	CST6	P40535	587 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PSH1	YOL054W	BRE2	P43132	505 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PSH1	YOL054W	ENV9	Q08651	330 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PSH1	YOL054W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	KTR7	P40504	517 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	CLA4	P48562	842 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	CAT8	P39113	1433 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TUB4	P53378	473 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	IRC20	Q06554	1556 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	PEP12	P32854	288 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	EMP47	P43555	445 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	RPA14	P50106	137 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	ECM23	Q02710	187 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	ALR1	Q08269	859 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TEC1	P18412	486 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	ISF1	P32488	338 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	ATG3	P40344	310 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	SEC2	P17065	759 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	GCR2	Q01722	534 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	HAT1	Q12341	374 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	PDR10	P51533	1564 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	GUT2	P32191	649 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	RTT106	P40161	455 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	MRX12	P47084	519 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	AGE1	Q04412	482 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PSH1	YOL054W	DRS2	P39524	1355 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	KXD1	P53158	218 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	YPR097W	Q06839	1073 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	GCN2	P15442	1659 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	NTE1	Q04958	1679 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	GAL2	P13181	574 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	UBX7	P38349	436 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	SRB8	P25648	1427 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	FIG4	P42837	879 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	FRA1	Q07825	749 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	RRN7	P40992	514 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	NUP159	P40477	1460 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PSH1	YOL054W	CDC4	P07834	779 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	PHO87	P25360	923 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.45	□□□□□ -1.22	not detected
PSH1	YOL054W	SOH1	P38633	127 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	GDB1	Q06625	1536 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	HAP4	P14064	554 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	HEM3	P28789	327 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	BDP1	P46678	594 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	YPR084W	Q06821	456 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	SPT7	P35177	1332 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	HXT10	P43581	546 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	PDR12	Q02785	1511 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	MET22	P32179	357 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	KAR5	Q04746	504 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	SEC20	P28791	383 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	APL6	P46682	809 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	HED1	Q03937	162 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	DNF2	Q12675	1612 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PSH1	YOL054W	IQG1	Q12280	1495 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	VAC17	P25591	423 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	GAS4	Q08271	471 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	TSC13	Q99190	310 aa		7.39	□□□□□ -1.23

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