RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W CLB5P30283 435 aa7.35□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W SPT23P35210 1082 aa7.35□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W YBL086CP38177 466 aa7.34□□□□□ -1.23
TIM54YJL054W URB1P34241 1764 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W UGA2P38067 497 aa7.33□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W NPR2P39923 615 aa7.33□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W YJL181WP46987 611 aa7.33□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W ENP1P38333 483 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W BNI4P53858 892 aa7.32□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W NPL4P33755 580 aa7.31□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W YKL133CP36066 463 aa7.31□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W LAM6Q08001 693 aa7.31□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W NUD1P32336 851 aa7.3□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W XKS1P42826 600 aa7.3□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W ALD2P47771 506 aa7.3□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W NIS1P53939 407 aa7.3□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W PRP40P33203 583 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W COBP00163 385 aa7.28□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W GUA1P38625 525 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W CSN12P47130 423 aa7.27□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W FPK1P53739 893 aa7.27□□□□□ -1.24
TIM54YJL054W YRF1-3P0CX14 1859 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YRF1-7P0CX15 1859 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YRF1-6P53819 1859 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YML133CQ03099 1374 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YLL067CQ07888 1374 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YLL066CQ99208 1374 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YKR075CP36155 307 aa7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W FKS3Q04952 1785 aa7.25□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W KEX2P13134 814 aa7.25□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W SCJ1P25303 377 aa7.25□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W CTH1P47976 325 aa7.25□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W ISM1P48526 1002 aa7.25□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W RTF1P53064 558 aa7.24□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W DMA2P53924 522 aa7.24□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W MEC3Q02574 474 aa7.24□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W GAS4Q08271 471 aa7.24□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W PDI1P17967 522 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W RAM1P22007 431 aa7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W STR2P47164 639 aa7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W SRC1Q03707 834 aa7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W MMP1Q12372 583 aa7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YRF1-4O13559 1382 aa7.23□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W ERF2Q06551 359 aa7.22□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W YPR015CQ12531 247 aa7.22□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W APC1P53886 1748 aa7.22□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W SLY41P22215 453 aa7.21□□□□□ -1.25
TIM54YJL054W SPT7P35177 1332 aa7.21□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W SIT4P20604 311 aa7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W ESS1P22696 170 aa7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W HST2P53686 357 aa7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W YNL115CP53925 644 aa7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W YIL177CP40434 1758 aa7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W YJL225CP40889 1758 aa7.2□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W GRX4P32642 244 aa7.19□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W ADE16P54113 591 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W TAP42Q04372 366 aa7.19□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W SIR4P11978 1358 aa7.19□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W GYP1Q08484 637 aa7.18□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W ALD3P54114 506 aa7.18□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W HGH1P48362 394 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W ATG13Q06628 738 aa7.16□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W AUS1Q08409 1394 aa7.15□□□□□ -1.26
TIM54YJL054W SNF2P22082 1703 aa7.15□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W YJU3P28321 313 aa7.15□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W BRL1P38770 471 aa7.15□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TFB3Q03290 321 aa7.15□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W HIM1Q06674 414 aa7.15□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-DR4O74302 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-AP0CX57 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.14□□□□□ -1.27
TIM54YJL054W SEC2P17065 759 aa7.14□□□□□ -1.27
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