RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W ARG8P18544 423 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W AIR1P40507 360 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W ERF2Q06551 359 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W OPT2Q06593 877 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W ICP55P40051 511 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W FRA1Q07825 749 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W TY1A-BLQ12266 440 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W MET1P36150 593 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W MCM1P11746 286 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W KIN1P13185 1064 aa2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W ADE12P80210 433 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W AI1P03875 834 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W YBR287WP38355 427 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W JJJ3P47138 172 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W YJR098CP47139 656 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W GLC3P32775 704 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W RAD59Q12223 238 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa2.59□□□□□ -1.99
MDS3YGL197W THO2P53552 1597 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
MDS3YGL197W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2 RIP-Chip
MDS3YGL197W OSH7P38755 437 aa2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W ISU1Q03020 165 aa2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W TY1A-MR1Q04215 440 aa2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W PUS5Q06244 254 aa2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W YDL176WQ12027 708 aa2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
MDS3YGL197W YRF1-1P0CX20 1796 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W YRF1-5P0CX21 1796 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W YRF1-8P0CX22 1796 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W SWR1Q05471 1514 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W FIG4P42837 879 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W ROG3P43602 733 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W CLA4P48562 842 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W BPT1P14772 1559 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W CEM1P39525 442 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W ATG20Q07528 640 aa2.57□□□□□ -2
MDS3YGL197W ESS1P22696 170 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W HEH2Q03281 663 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W UTR2P32623 467 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W YBL036CP38197 257 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W CAF120P53836 1060 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W TCB1Q12466 1186 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W YTA6P40328 754 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W TFB3Q03290 321 aa2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
MDS3YGL197W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
MDS3YGL197W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
MDS3YGL197W CDC19P00549 500 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
MDS3YGL197W DFG5Q05031 458 aa2.55□□□□□ -2
MDS3YGL197W DIT1P21623 536 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W LEO1P38439 464 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W YIR007WP40566 764 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W SPO14P36126 1683 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W ECM5Q03214 1411 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W APL6P46682 809 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W MCM16Q12262 181 aa2.54□□□□□ -2
MDS3YGL197W YPR084WQ06821 456 aa2.53□□□□□ -2
MDS3YGL197W WTM2Q12206 467 aa2.53□□□□□ -2
MDS3YGL197W PDR10P51533 1564 aa2.53□□□□□ -2
MDS3YGL197W IRC20Q06554 1556 aa2.53□□□□□ -2
MDS3YGL197W SUM1P46676 1062 aa2.53□□□□□ -2
MDS3YGL197W HPF1Q05164 967 aa2.53□□□□□ -2
MDS3YGL197W SCD5P34758 872 aa2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W RSC2Q06488 889 aa2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SLP1Q12232 587 aa2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W YPR053CQ6Q5F3 151 aa2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W CWH41P53008 833 aa2.52□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W DAT1P13483 248 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W YJU3P28321 313 aa2.51□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SYT1Q06836 1226 aa2.51□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W HAP4P14064 554 aa2.51□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W LEM3P42838 414 aa2.51□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W FPS1P23900 669 aa2.5□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W UBP1P25037 809 aa2.5□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SCJ1P25303 377 aa2.5□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W GAS4Q08271 471 aa2.5□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W LEU1P07264 779 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W KTR1P27810 393 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W NSG2P53898 299 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W YIL177CP40434 1758 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W YJL225CP40889 1758 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W GCN2P15442 1659 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SLX8P40072 274 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W CUZ1P53899 274 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SGS1P35187 1447 aa2.49□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W JJJ2P46997 583 aa2.48□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W IRE1P32361 1115 aa2.48□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SFA1P32771 386 aa2.48□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SSN3P39073 555 aa2.48□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W REV3P14284 1504 aa2.48□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W SUP45P12385 437 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
MDS3YGL197W APP1P53933 587 aa2.48□□□□□ -2.01
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