RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.33■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.33■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 ZFYVE9O95405 1425 aa33.32■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.3■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 TRPM2O94759 1503 aa33.27■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.26■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa33.26■■■□□ 2.92
SYT6-210ENST00000641643 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.26■■■□□ 2.91
SYT6-210ENST00000641643 FOXD1Q16676 465 aa33.21■■■□□ 2.91
SYT6-210ENST00000641643 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.2■■■□□ 2.91
SYT6-210ENST00000641643 CLTCL1P53675 1640 aa33.2■■■□□ 2.91
SYT6-210ENST00000641643 KCNA6P17658 529 aa33.18■■■□□ 2.9
SYT6-210ENST00000641643 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.18■■■□□ 2.9
SYT6-210ENST00000641643 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.16■■■□□ 2.9
SYT6-210ENST00000641643 TOM1O60784 492 aa33.16■■■□□ 2.9
SYT6-210ENST00000641643 TBX22Q9Y458 520 aa33.14■■■□□ 2.9
SYT6-210ENST00000641643 KIF1BO60333 1816 aa33.13■■■□□ 2.89
SYT6-210ENST00000641643 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.09■■■□□ 2.89
SYT6-210ENST00000641643 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
SYT6-210ENST00000641643 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa33.06■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 PIP4K2BP78356 416 aa33.05■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 HRCP23327 699 aa33.04■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.04■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 TMEM94Q12767 1356 aa33.03■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 DIP2AQ14689 1571 aa33.03■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.02■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
SYT6-210ENST00000641643 PIK3R4Q99570 1358 aa33.01■■■□□ 2.87
SYT6-210ENST00000641643 NWD1Q149M9 1564 aa33■■■□□ 2.87
SYT6-210ENST00000641643 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
SYT6-210ENST00000641643 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
SYT6-210ENST00000641643 RGL3Q3MIN7 710 aa32.96■■■□□ 2.87
SYT6-210ENST00000641643 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.96■■■□□ 2.87
SYT6-210ENST00000641643 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.93■■■□□ 2.86
SYT6-210ENST00000641643 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.91■■■□□ 2.86
SYT6-210ENST00000641643 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
SYT6-210ENST00000641643 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.89■■■□□ 2.86
SYT6-210ENST00000641643 C14orf37Q86TY3 774 aa32.88■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 MSH6P52701 1360 aa32.88■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 ALKQ9UM73 1620 aa32.86■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 METP08581 1390 aa32.86■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 PTPRUQ92729 1446 aa32.85■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.84■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 PPLO60437 1756 aa32.84■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 HSPA1LP34931 641 aa32.83■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.83■■■□□ 2.85
SYT6-210ENST00000641643 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.79■■■□□ 2.84
SYT6-210ENST00000641643 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.76■■■□□ 2.84
SYT6-210ENST00000641643 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
SYT6-210ENST00000641643 ATF3P18847 181 aa32.72■■■□□ 2.83
SYT6-210ENST00000641643 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.72■■■□□ 2.83
SYT6-210ENST00000641643 SLAIN2Q9P270 581 aa32.72■■■□□ 2.83
SYT6-210ENST00000641643 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.71■■■□□ 2.83
SYT6-210ENST00000641643 IFT172Q9UG01 1749 aa32.69■■■□□ 2.82
SYT6-210ENST00000641643 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
SYT6-210ENST00000641643 PIK3C2GO75747 1445 aa32.65■■■□□ 2.82
SYT6-210ENST00000641643 PTCH1Q13635 1447 aa32.63■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 MYOM2P54296 1465 aa32.61■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.6■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 DCCP43146 1447 aa32.59■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.59■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.59■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.58■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 STK26Q9P289 416 aa32.58■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.58■■■□□ 2.81
SYT6-210ENST00000641643 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.57■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.57■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.57■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.57■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 STAC3Q96MF2 364 aa32.56■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 CFAP70Q5T0N1 1121 aa32.54■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
SYT6-210ENST00000641643 ABCC11Q96J66 1382 aa32.51■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa32.48■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 TECPR2O15040 1411 aa32.48■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.47■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 LAMC1P11047 1609 aa32.46■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 MST1RQ04912 1400 aa32.46■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.45■■■□□ 2.79
SYT6-210ENST00000641643 BRINP3Q76B58 766 aa32.45■■■□□ 2.78
SYT6-210ENST00000641643 SIRT1Q96EB6 747 aa32.4■■■□□ 2.78
SYT6-210ENST00000641643 PHLPP1O60346 1717 aa32.39■■■□□ 2.78
SYT6-210ENST00000641643 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.39■■■□□ 2.78
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa32.37■■■□□ 2.77
SYT6-210ENST00000641643 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
SYT6-210ENST00000641643 C1orf167Q5SNV9 1468 aa32.35■■■□□ 2.77
SYT6-210ENST00000641643 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.34■■■□□ 2.77
SYT6-210ENST00000641643 POGKQ9P215 609 aa32.33■■■□□ 2.77
SYT6-210ENST00000641643 JCADQ9P266 1359 aa32.33■■■□□ 2.77
SYT6-210ENST00000641643 NEUROD1Q13562 356 aa32.32■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms