RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF1BO60333 1816 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 HRCP23327 699 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRB3O60242 1522 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 SLIT1O75093 1534 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 CERKQ8TCT0 537 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 CLTCL1P53675 1640 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 IQGAP1P46940 1657 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 MED14O60244 1454 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 RGL3Q3MIN7 710 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPM2O94759 1503 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYVE9O95405 1425 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO41Q8TF61 875 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 TBX22Q9Y458 520 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNA6P17658 529 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 PPLO60437 1756 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 CPS1P31327 1500 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 NEUROD1Q13562 356 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT172Q9UG01 1749 aa9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 TOM1O60784 492 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 PIP4K2BP78356 416 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 METP08581 1390 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 DIP2AQ14689 1571 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 C14orf37Q86TY3 774 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 ALKQ9UM73 1620 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRUQ92729 1446 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM94Q12767 1356 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 STK26Q9P289 416 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3R4Q99570 1358 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 NWD1Q149M9 1564 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-211ENST00000588374 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 STAC3Q96MF2 364 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 ATF3P18847 181 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEHQ6S545 545 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 MSH6P52701 1360 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3C2GO75747 1445 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOM2P54296 1465 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 SLAIN2Q9P270 581 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA1LP34931 641 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMC1P11047 1609 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 POGKQ9P215 609 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms