RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-209ENST00000566749 ZFYVE9O95405 1425 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP4C-209ENST00000566749 CLTCL1P53675 1640 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-209ENST00000566749 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-209ENST00000566749 FOXD1Q16676 465 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-209ENST00000566749 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 BCANQ96GW7 911 aa36.56■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 KIF1BO60333 1816 aa36.53■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 CPS1P31327 1500 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
PPP4C-209ENST00000566749 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.5■■■■□ 3.43
PPP4C-209ENST00000566749 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.5■■■■□ 3.43
PPP4C-209ENST00000566749 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.5■■■■□ 3.43
PPP4C-209ENST00000566749 HRCP23327 699 aa36.46■■■■□ 3.43
PPP4C-209ENST00000566749 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.45■■■■□ 3.43
PPP4C-209ENST00000566749 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP4C-209ENST00000566749 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.36■■■■□ 3.41
PPP4C-209ENST00000566749 KCNA6P17658 529 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-209ENST00000566749 TBX22Q9Y458 520 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-209ENST00000566749 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-209ENST00000566749 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.32■■■■□ 3.4
PPP4C-209ENST00000566749 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-209ENST00000566749 DIP2AQ14689 1571 aa36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-209ENST00000566749 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-209ENST00000566749 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 RGL3Q3MIN7 710 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 NWD1Q149M9 1564 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 PPLO60437 1756 aa36.22■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 PIK3R4Q99570 1358 aa36.2■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.2■■■■□ 3.39
PPP4C-209ENST00000566749 TOM1O60784 492 aa36.18■■■■□ 3.38
PPP4C-209ENST00000566749 TMEM94Q12767 1356 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP4C-209ENST00000566749 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
PPP4C-209ENST00000566749 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
PPP4C-209ENST00000566749 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.11■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 IFT172Q9UG01 1749 aa36.1■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 METP08581 1390 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 PIP4K2BP78356 416 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 PTPRUQ92729 1446 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-209ENST00000566749 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.07■■■■□ 3.36
PPP4C-209ENST00000566749 ALKQ9UM73 1620 aa36.04■■■■□ 3.36
PPP4C-209ENST00000566749 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
PPP4C-209ENST00000566749 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
PPP4C-209ENST00000566749 MSH6P52701 1360 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP4C-209ENST00000566749 C14orf37Q86TY3 774 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP4C-209ENST00000566749 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP4C-209ENST00000566749 PIK3C2GO75747 1445 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4C-209ENST00000566749 MYOM2P54296 1465 aa35.93■■■■□ 3.34
PPP4C-209ENST00000566749 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.88■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.87■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 PTCH1Q13635 1447 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 HSPA1LP34931 641 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-209ENST00000566749 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 ATF3P18847 181 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 STAC3Q96MF2 364 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 SLAIN2Q9P270 581 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.79■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 LAMC1P11047 1609 aa35.79■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 STK26Q9P289 416 aa35.79■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.78■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP4C-209ENST00000566749 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.74■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 DCCP43146 1447 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 ABCC11Q96J66 1382 aa35.71■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 TECPR2O15040 1411 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP4C-209ENST00000566749 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP4C-209ENST00000566749 NEUROD1Q13562 356 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP4C-209ENST00000566749 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP4C-209ENST00000566749 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.6■■■■□ 3.29
PPP4C-209ENST00000566749 ADGRB1O14514 1584 aa35.6■■■■□ 3.29
PPP4C-209ENST00000566749 MST1RQ04912 1400 aa35.6■■■■□ 3.29
PPP4C-209ENST00000566749 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-209ENST00000566749 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-209ENST00000566749 SIRT1Q96EB6 747 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-209ENST00000566749 BRINP3Q76B58 766 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP4C-209ENST00000566749 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP4C-209ENST00000566749 PRAM1Q96QH2 718 aa35.52■■■■□ 3.28
PPP4C-209ENST00000566749 PHLPP1O60346 1717 aa35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms