RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 ZFYVE9O95405 1425 aa30.83■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.83■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.82■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 STRCQ7RTU9 1775 aa30.82■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 SLIT1O75093 1534 aa30.81■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 EID1Q9Y6B2 187 aa30.81■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 BCANQ96GW7 911 aa30.8■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.78■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.77■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.76■■■□□ 2.52
MEIS3-212ENST00000561293 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.75■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.74■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
MEIS3-212ENST00000561293 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 PPLO60437 1756 aa30.67■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.66■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 TONSLQ96HA7 1378 aa30.64■■■□□ 2.5
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.63■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 IFT172Q9UG01 1749 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 MED14O60244 1454 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 IQGAP1P46940 1657 aa30.62■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.59■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.58■■■□□ 2.49
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.57■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.57■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.55■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3C2GO75747 1445 aa30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 METP08581 1390 aa30.54■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.53■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 MYOM2P54296 1465 aa30.53■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.52■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
MEIS3-212ENST00000561293 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.5■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.49■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 ALKQ9UM73 1620 aa30.48■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.47■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 STK26Q9P289 416 aa30.45■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 TBX22Q9Y458 520 aa30.45■■■□□ 2.47
MEIS3-212ENST00000561293 PTPRUQ92729 1446 aa30.45■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.42■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 KCNA6P17658 529 aa30.41■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.4■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.39■■■□□ 2.46
MEIS3-212ENST00000561293 DIP2AQ14689 1571 aa30.34■■■□□ 2.45
MEIS3-212ENST00000561293 STAC3Q96MF2 364 aa30.33■■■□□ 2.45
MEIS3-212ENST00000561293 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.32■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRB1O14514 1584 aa30.3■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.29■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.29■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.27■■■□□ 2.44
MEIS3-212ENST00000561293 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.26■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.25■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3R4Q99570 1358 aa30.24■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 LAMC1P11047 1609 aa30.24■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM94Q12767 1356 aa30.23■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 NWD1Q149M9 1564 aa30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.21■■■□□ 2.43
MEIS3-212ENST00000561293 PRAM1Q96QH2 718 aa30.2■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 C14orf37Q86TY3 774 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC11Q96J66 1382 aa30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
MEIS3-212ENST00000561293 CPS1P31327 1500 aa30.14■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 CERKQ8TCT0 537 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 POGKQ9P215 609 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 TECPR2O15040 1411 aa30.11■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 PTCH1Q13635 1447 aa30.11■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-212ENST00000561293 NUTM2FA1L443 756 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.01■■■□□ 2.4
MEIS3-212ENST00000561293 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 USP47Q96K76 1375 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 DLC1Q96QB1 1528 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms