RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561068.5

RPS17-208, Transcript of ribosomal protein S17, human

TSL 3

Gene RPS17, Length 522 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS17-208	ENST00000561068	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RPS17-208	ENST00000561068	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
RPS17-208	ENST00000561068	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RPS17-208	ENST00000561068	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RPS17-208	ENST00000561068	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RPS17-208	ENST00000561068	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ABCC1	P33527	1531 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ARSI	Q5FYB1	569 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	AFAP1	Q8N556	730 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	RIMBP2	O15034	1052 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ATP10A	O60312	1499 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ABCA6	Q8N139	1617 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	MADD	Q8WXG6	1647 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	STK25	O00506	426 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	GPR153	Q6NV75	609 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	RERE	Q9P2R6	1566 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	NLRP6	P59044	892 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	RGL2	O15211	777 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.59	□□□□□ -1.19	1e-6	■■■■□ 19.5
RPS17-208	ENST00000561068	NCOA2	Q15596	1464 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	MBD5	Q9P267	1494 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPS17-208	ENST00000561068	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	PTPRM	P28827	1452 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	AGL	P35573	1532 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	C2orf72	A6NCS6	295 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	PKD2	Q13563	968 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	C3	P01024	1663 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	PPP1R37	O75864	691 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	NUDT7	P0C024	238 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RPS17-208	ENST00000561068	MROH2A	A6NES4	1674 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	MLEC	Q14165	292 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	MIA2	Q96PC5	1412 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	A2M	P01023	1474 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	KIF3C	O14782	793 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	STRC	Q7RTU9	1775 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	LHX6	Q9UPM6	363 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	ABCC5	O15440	1437 aa		7.46	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
RPS17-208	ENST00000561068	TMC2	Q8TDI7	906 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS17-208	ENST00000561068	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS17-208	ENST00000561068	ZMYM3	Q14202	1370 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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