RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CLTCL1P53675 1640 aa27.68■■■□□ 2.02
GCSHP2-201ENST00000560971 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
GCSHP2-201ENST00000560971 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
GCSHP2-201ENST00000560971 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
GCSHP2-201ENST00000560971 BCANQ96GW7 911 aa27.63■■■□□ 2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.63■■■□□ 2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.6■■■□□ 2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 CPS1P31327 1500 aa27.58■■■□□ 2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.57■■■□□ 2
GCSHP2-201ENST00000560971 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.56■■■□□ 2
GCSHP2-201ENST00000560971 HRCP23327 699 aa27.55■■■□□ 2
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF1BO60333 1816 aa27.53■■■□□ 2
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.51■■□□□ 1.99
GCSHP2-201ENST00000560971 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.49■■□□□ 1.99
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.49■■□□□ 1.99
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.49■■□□□ 1.99
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNA6P17658 529 aa27.48■■□□□ 1.99
GCSHP2-201ENST00000560971 TBX22Q9Y458 520 aa27.48■■□□□ 1.99
GCSHP2-201ENST00000560971 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.45■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 RGL3Q3MIN7 710 aa27.43■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.42■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.41■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.41■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 DIP2AQ14689 1571 aa27.39■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.39■■□□□ 1.98
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.39■■□□□ 1.98
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GCSHP2-201ENST00000560971 NWD1Q149M9 1564 aa27.39■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM94Q12767 1356 aa27.36■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 PPLO60437 1756 aa27.35■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 METP08581 1390 aa27.34■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 PIK3R4Q99570 1358 aa27.34■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRUQ92729 1446 aa27.33■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 TOM1O60784 492 aa27.33■■□□□ 1.97
GCSHP2-201ENST00000560971 PIP4K2BP78356 416 aa27.32■■□□□ 1.96
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
GCSHP2-201ENST00000560971 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.32■■□□□ 1.96
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.31■■□□□ 1.96
GCSHP2-201ENST00000560971 ALKQ9UM73 1620 aa27.3■■□□□ 1.96
GCSHP2-201ENST00000560971 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
GCSHP2-201ENST00000560971 IFT172Q9UG01 1749 aa27.26■■□□□ 1.95
GCSHP2-201ENST00000560971 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
GCSHP2-201ENST00000560971 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
GCSHP2-201ENST00000560971 C14orf37Q86TY3 774 aa27.19■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 MSH6P52701 1360 aa27.19■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 PIK3C2GO75747 1445 aa27.17■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.16■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 MYOM2P54296 1465 aa27.15■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.14■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA1LP34931 641 aa27.14■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.14■■□□□ 1.94
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.13■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.12■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.12■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.11■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.1■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 SLAIN2Q9P270 581 aa27.09■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 STK26Q9P289 416 aa27.09■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.08■■□□□ 1.93
GCSHP2-201ENST00000560971 PTCH1Q13635 1447 aa27.07■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ATF3P18847 181 aa27.06■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.06■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.05■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.05■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.04■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.02■■□□□ 1.92
GCSHP2-201ENST00000560971 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 STAC3Q96MF2 364 aa27.01■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC11Q96J66 1382 aa27■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 TECPR2O15040 1411 aa26.99■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.99■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMC1P11047 1609 aa26.99■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 NEUROD1Q13562 356 aa26.99■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.99■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 DCCP43146 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.96■■□□□ 1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.93■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRB1O14514 1584 aa26.93■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 MST1RQ04912 1400 aa26.93■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.93■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.93■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 BRINP3Q76B58 766 aa26.9■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 SIRT1Q96EB6 747 aa26.9■■□□□ 1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.88■■□□□ 1.89
GCSHP2-201ENST00000560971 PRAM1Q96QH2 718 aa26.87■■□□□ 1.89
GCSHP2-201ENST00000560971 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
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