RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC25A3-211ENST00000548847 CPS1P31327 1500 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC25A3-211ENST00000548847 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC25A3-211ENST00000548847 FOXD1Q16676 465 aa28.58■■■□□ 2.17
SLC25A3-211ENST00000548847 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.56■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 KIF1BO60333 1816 aa28.52■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
SLC25A3-211ENST00000548847 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SLC25A3-211ENST00000548847 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC25A3-211ENST00000548847 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC25A3-211ENST00000548847 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.47■■■□□ 2.15
SLC25A3-211ENST00000548847 HRCP23327 699 aa28.45■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 BCANQ96GW7 911 aa28.45■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 NWD1Q149M9 1564 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 KCNA6P17658 529 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 TBX22Q9Y458 520 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 DIP2AQ14689 1571 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A3-211ENST00000548847 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 ALKQ9UM73 1620 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 PPLO60437 1756 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A3-211ENST00000548847 TMEM94Q12767 1356 aa28.31■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 PIK3R4Q99570 1358 aa28.31■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.31■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 PTPRUQ92729 1446 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 IFT172Q9UG01 1749 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 TOM1O60784 492 aa28.26■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 RGL3Q3MIN7 710 aa28.26■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
SLC25A3-211ENST00000548847 METP08581 1390 aa28.26■■■□□ 2.11
SLC25A3-211ENST00000548847 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SLC25A3-211ENST00000548847 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SLC25A3-211ENST00000548847 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.22■■■□□ 2.11
SLC25A3-211ENST00000548847 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A3-211ENST00000548847 PIP4K2BP78356 416 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC25A3-211ENST00000548847 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-211ENST00000548847 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-211ENST00000548847 PIK3C2GO75747 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC25A3-211ENST00000548847 MSH6P52701 1360 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC25A3-211ENST00000548847 MYOM2P54296 1465 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC25A3-211ENST00000548847 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC25A3-211ENST00000548847 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SLC25A3-211ENST00000548847 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A3-211ENST00000548847 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 HSPA1LP34931 641 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 PTCH1Q13635 1447 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 C14orf37Q86TY3 774 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SLC25A3-211ENST00000548847 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 SLAIN2Q9P270 581 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 TECPR2O15040 1411 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 DCCP43146 1447 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 LAMC1P11047 1609 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC25A3-211ENST00000548847 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 ATF3P18847 181 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCC11Q96J66 1382 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 STK26Q9P289 416 aa27.92■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 STAC3Q96MF2 364 aa27.91■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 ADGRB1O14514 1584 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 MST1RQ04912 1400 aa27.89■■■□□ 2.06
SLC25A3-211ENST00000548847 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC25A3-211ENST00000548847 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC25A3-211ENST00000548847 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC25A3-211ENST00000548847 BRINP3Q76B58 766 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 SIRT1Q96EB6 747 aa27.81■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 DLC1Q96QB1 1528 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 PHLPP1O60346 1717 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC25A3-211ENST00000548847 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 685.7 ms