RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PUF60-222	ENST00000533362	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PUF60-222	ENST00000533362	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PUF60-222	ENST00000533362	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PUF60-222	ENST00000533362	LTK	P29376	864 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PUF60-222	ENST00000533362	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PUF60-222	ENST00000533362	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PUF60-222	ENST00000533362	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PUF60-222	ENST00000533362	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PUF60-222	ENST00000533362	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PUF60-222	ENST00000533362	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PUF60-222	ENST00000533362	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PUF60-222	ENST00000533362	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PUF60-222	ENST00000533362	PPL	O60437	1756 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PUF60-222	ENST00000533362	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PUF60-222	ENST00000533362	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PUF60-222	ENST00000533362	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PUF60-222	ENST00000533362	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PUF60-222	ENST00000533362	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PUF60-222	ENST00000533362	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PUF60-222	ENST00000533362	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PUF60-222	ENST00000533362	CPS1	P31327	1500 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	MYOM2	P54296	1465 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PUF60-222	ENST00000533362	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PUF60-222	ENST00000533362	KCNA6	P17658	529 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PUF60-222	ENST00000533362	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PUF60-222	ENST00000533362	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PUF60-222	ENST00000533362	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PUF60-222	ENST00000533362	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PUF60-222	ENST00000533362	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	LAMC1	P11047	1609 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PUF60-222	ENST00000533362	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PUF60-222	ENST00000533362	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PUF60-222	ENST00000533362	MET	P08581	1390 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PUF60-222	ENST00000533362	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PUF60-222	ENST00000533362	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PUF60-222	ENST00000533362	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PUF60-222	ENST00000533362	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PUF60-222	ENST00000533362	TECPR2	O15040	1411 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	MSH6	P52701	1360 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	TOM1	O60784	492 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PUF60-222	ENST00000533362	STK26	Q9P289	416 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PUF60-222	ENST00000533362	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PUF60-222	ENST00000533362	DCC	P43146	1447 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PUF60-222	ENST00000533362	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PUF60-222	ENST00000533362	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PUF60-222	ENST00000533362	ATF3	P18847	181 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PUF60-222	ENST00000533362	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PUF60-222	ENST00000533362	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PUF60-222	ENST00000533362	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PUF60-222	ENST00000533362	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PUF60-222	ENST00000533362	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PUF60-222	ENST00000533362	POGK	Q9P215	609 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PUF60-222	ENST00000533362	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PUF60-222	ENST00000533362	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.01	■■■□□ 2.71

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