RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PITX1-204ENST00000504936 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.14■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 CERKQ8TCT0 537 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 ZFYVE9O95405 1425 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX1-204ENST00000504936 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX1-204ENST00000504936 CPS1P31327 1500 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-204ENST00000504936 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-204ENST00000504936 HRCP23327 699 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 PPLO60437 1756 aa28■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 DIP2AQ14689 1571 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 FBXO41Q8TF61 875 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.95■■■□□ 2.07
PITX1-204ENST00000504936 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
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PITX1-204ENST00000504936 RGL3Q3MIN7 710 aa27.93■■■□□ 2.06
PITX1-204ENST00000504936 IFT172Q9UG01 1749 aa27.92■■■□□ 2.06
PITX1-204ENST00000504936 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.91■■■□□ 2.06
PITX1-204ENST00000504936 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.9■■■□□ 2.06
PITX1-204ENST00000504936 NWD1Q149M9 1564 aa27.88■■■□□ 2.05
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PITX1-204ENST00000504936 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.87■■■□□ 2.05
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PITX1-204ENST00000504936 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.86■■■□□ 2.05
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.86■■■□□ 2.05
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PITX1-204ENST00000504936 TBX22Q9Y458 520 aa27.85■■■□□ 2.05
PITX1-204ENST00000504936 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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PITX1-204ENST00000504936 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PITX1-204ENST00000504936 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PITX1-204ENST00000504936 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PITX1-204ENST00000504936 PIK3R4Q99570 1358 aa27.77■■■□□ 2.04
PITX1-204ENST00000504936 ALKQ9UM73 1620 aa27.76■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 TMEM94Q12767 1356 aa27.75■■■□□ 2.03
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PITX1-204ENST00000504936 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 TOM1O60784 492 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 C14orf37Q86TY3 774 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 METP08581 1390 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX1-204ENST00000504936 PIP4K2BP78356 416 aa27.71■■■□□ 2.03
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PITX1-204ENST00000504936 MYOM2P54296 1465 aa27.69■■■□□ 2.02
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PITX1-204ENST00000504936 MSH6P52701 1360 aa27.66■■■□□ 2.02
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PITX1-204ENST00000504936 PIK3C2GO75747 1445 aa27.66■■■□□ 2.02
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PITX1-204ENST00000504936 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PITX1-204ENST00000504936 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.6■■■□□ 2.01
PITX1-204ENST00000504936 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.58■■■□□ 2.01
PITX1-204ENST00000504936 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.58■■■□□ 2.01
PITX1-204ENST00000504936 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.58■■■□□ 2.01
PITX1-204ENST00000504936 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.57■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 STK26Q9P289 416 aa27.57■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 NEUROD1Q13562 356 aa27.56■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.56■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 PTCH1Q13635 1447 aa27.55■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.54■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.54■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.53■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 ATF3P18847 181 aa27.52■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.52■■■□□ 2
PITX1-204ENST00000504936 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.5■■□□□ 1.99
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PITX1-204ENST00000504936 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.49■■□□□ 1.99
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PITX1-204ENST00000504936 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.47■■□□□ 1.99
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PITX1-204ENST00000504936 DCCP43146 1447 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 TECPR2O15040 1411 aa27.43■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 HSPA1LP34931 641 aa27.43■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.43■■□□□ 1.98
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PITX1-204ENST00000504936 ABCC11Q96J66 1382 aa27.41■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 ADGRB1O14514 1584 aa27.4■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.4■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 PHLPP1O60346 1717 aa27.39■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.39■■□□□ 1.98
PITX1-204ENST00000504936 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.39■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 TONSLQ96HA7 1378 aa27.37■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.36■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.36■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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