RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475176.1

NOM1-205, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene NOM1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-205ENST00000475176 FOXD1Q16676 465 aa26.61■■□□□ 1.85
NOM1-205ENST00000475176 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
NOM1-205ENST00000475176 CLTCL1P53675 1640 aa26.6■■□□□ 1.85
NOM1-205ENST00000475176 ZFYVE9O95405 1425 aa26.59■■□□□ 1.85
NOM1-205ENST00000475176 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
NOM1-205ENST00000475176 HRCP23327 699 aa26.57■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 KIF1BO60333 1816 aa26.56■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 FBXO41Q8TF61 875 aa26.55■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.53■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 CPS1P31327 1500 aa26.52■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NOM1-205ENST00000475176 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.51■■□□□ 1.83
NOM1-205ENST00000475176 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.51■■□□□ 1.83
NOM1-205ENST00000475176 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
NOM1-205ENST00000475176 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.42■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.41■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.41■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 TBX22Q9Y458 520 aa26.41■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 KCNA6P17658 529 aa26.4■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NOM1-205ENST00000475176 DIP2AQ14689 1571 aa26.38■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 RGL3Q3MIN7 710 aa26.38■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.37■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.36■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.35■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.33■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.33■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.33■■□□□ 1.81
NOM1-205ENST00000475176 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 PPLO60437 1756 aa26.32■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 PIK3R4Q99570 1358 aa26.32■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 NWD1Q149M9 1564 aa26.31■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.3■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 TOM1O60784 492 aa26.28■■□□□ 1.8
NOM1-205ENST00000475176 TMEM94Q12767 1356 aa26.26■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.24■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 IFT172Q9UG01 1749 aa26.22■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.22■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 METP08581 1390 aa26.21■■□□□ 1.79
NOM1-205ENST00000475176 PIP4K2BP78356 416 aa26.2■■□□□ 1.78
NOM1-205ENST00000475176 PTPRUQ92729 1446 aa26.2■■□□□ 1.78
NOM1-205ENST00000475176 ALKQ9UM73 1620 aa26.19■■□□□ 1.78
NOM1-205ENST00000475176 C14orf37Q86TY3 774 aa26.18■■□□□ 1.78
NOM1-205ENST00000475176 MSH6P52701 1360 aa26.16■■□□□ 1.78
NOM1-205ENST00000475176 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NOM1-205ENST00000475176 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.14■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 MYOM2P54296 1465 aa26.13■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 PIK3C2GO75747 1445 aa26.13■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.12■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.11■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 STAC3Q96MF2 364 aa26.09■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.08■■□□□ 1.77
NOM1-205ENST00000475176 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.07■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 ATF3P18847 181 aa26.05■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.04■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 PTCH1Q13635 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 LAMC1P11047 1609 aa26.03■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.03■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.03■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 STK26Q9P289 416 aa26.03■■□□□ 1.76
NOM1-205ENST00000475176 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.01■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 SLAIN2Q9P270 581 aa26.01■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 PRAG1Q86YV5 1406 aa26■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 HSPA1LP34931 641 aa25.99■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 NEUROD1Q13562 356 aa25.99■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.99■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.98■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.98■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.97■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 DCCP43146 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 ABCC11Q96J66 1382 aa25.96■■□□□ 1.75
NOM1-205ENST00000475176 TECPR2O15040 1411 aa25.95■■□□□ 1.74
NOM1-205ENST00000475176 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.94■■□□□ 1.74
NOM1-205ENST00000475176 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.93■■□□□ 1.74
NOM1-205ENST00000475176 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.93■■□□□ 1.74
NOM1-205ENST00000475176 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.91■■□□□ 1.74
NOM1-205ENST00000475176 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.9■■□□□ 1.74
NOM1-205ENST00000475176 SIRT1Q96EB6 747 aa25.88■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 ADGRB1O14514 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 POGKQ9P215 609 aa25.85■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 MST1RQ04912 1400 aa25.85■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.84■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.84■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 PRAM1Q96QH2 718 aa25.83■■□□□ 1.73
NOM1-205ENST00000475176 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.4 ms