RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444811.6

NELFE-206, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-206ENST00000444811 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
NELFE-206ENST00000444811 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.37■■■□□ 2.29
NELFE-206ENST00000444811 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.32■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 FOXD1Q16676 465 aa29.31■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.3■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.29■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 SOCS7O14512 581 aa29.29■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 CPS1P31327 1500 aa29.29■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.27■■■□□ 2.28
NELFE-206ENST00000444811 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
NELFE-206ENST00000444811 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
NELFE-206ENST00000444811 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
NELFE-206ENST00000444811 KIF1BO60333 1816 aa29.24■■■□□ 2.27
NELFE-206ENST00000444811 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.23■■■□□ 2.27
NELFE-206ENST00000444811 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
NELFE-206ENST00000444811 HRCP23327 699 aa29.2■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.19■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.17■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.17■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 BCANQ96GW7 911 aa29.16■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.14■■■□□ 2.26
NELFE-206ENST00000444811 NWD1Q149M9 1564 aa29.13■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.12■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 TBX22Q9Y458 520 aa29.12■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 DIP2AQ14689 1571 aa29.11■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 KCNA6P17658 529 aa29.11■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.09■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.09■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
NELFE-206ENST00000444811 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 HSPA1LP34931 641 aa29.06■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 PPLO60437 1756 aa29.06■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 ALKQ9UM73 1620 aa29.05■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.05■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.03■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 PIP4K2BP78356 416 aa29.03■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 PIK3R4Q99570 1358 aa29.01■■■□□ 2.24
NELFE-206ENST00000444811 TOM1O60784 492 aa29■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 PTPRUQ92729 1446 aa29■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 TMEM94Q12767 1356 aa28.99■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 IFT172Q9UG01 1749 aa28.98■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 RGL3Q3MIN7 710 aa28.98■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 METP08581 1390 aa28.96■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
NELFE-206ENST00000444811 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NELFE-206ENST00000444811 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NELFE-206ENST00000444811 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NELFE-206ENST00000444811 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.92■■■□□ 2.22
NELFE-206ENST00000444811 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.91■■■□□ 2.22
NELFE-206ENST00000444811 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
NELFE-206ENST00000444811 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.85■■■□□ 2.21
NELFE-206ENST00000444811 PIK3C2GO75747 1445 aa28.83■■■□□ 2.21
NELFE-206ENST00000444811 MYOM2P54296 1465 aa28.82■■■□□ 2.2
NELFE-206ENST00000444811 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.82■■■□□ 2.2
NELFE-206ENST00000444811 MSH6P52701 1360 aa28.8■■■□□ 2.2
NELFE-206ENST00000444811 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.78■■■□□ 2.2
NELFE-206ENST00000444811 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.77■■■□□ 2.2
NELFE-206ENST00000444811 PTCH1Q13635 1447 aa28.75■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.72■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 C14orf37Q86TY3 774 aa28.71■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.71■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.7■■■□□ 2.19
NELFE-206ENST00000444811 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.68■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 LAMC1P11047 1609 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.66■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 TECPR2O15040 1411 aa28.66■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 DCCP43146 1447 aa28.66■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 SLAIN2Q9P270 581 aa28.65■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.64■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.64■■■□□ 2.18
NELFE-206ENST00000444811 ABCC11Q96J66 1382 aa28.63■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 ATF3P18847 181 aa28.62■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 STAC3Q96MF2 364 aa28.62■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 STK26Q9P289 416 aa28.61■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 ADGRB1O14514 1584 aa28.59■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.59■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 MST1RQ04912 1400 aa28.58■■■□□ 2.17
NELFE-206ENST00000444811 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NELFE-206ENST00000444811 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.56■■■□□ 2.16
NELFE-206ENST00000444811 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.55■■■□□ 2.16
NELFE-206ENST00000444811 SIRT1Q96EB6 747 aa28.51■■■□□ 2.15
NELFE-206ENST00000444811 DLC1Q96QB1 1528 aa28.5■■■□□ 2.15
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