RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 MED14O60244 1454 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 ZFYVE9O95405 1425 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 KIF1BO60333 1816 aa26.72■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.72■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.72■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 RGL3Q3MIN7 710 aa26.68■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.67■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 BCANQ96GW7 911 aa26.67■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.66■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.64■■□□□ 1.86
PTX4-202ENST00000440447 IQGAP1P46940 1657 aa26.63■■□□□ 1.85
PTX4-202ENST00000440447 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.61■■□□□ 1.85
PTX4-202ENST00000440447 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTX4-202ENST00000440447 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTX4-202ENST00000440447 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.58■■□□□ 1.85
PTX4-202ENST00000440447 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PTX4-202ENST00000440447 TBX22Q9Y458 520 aa26.53■■□□□ 1.84
PTX4-202ENST00000440447 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.52■■□□□ 1.84
PTX4-202ENST00000440447 PPLO60437 1756 aa26.51■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.5■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 NEUROD1Q13562 356 aa26.5■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.49■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.48■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.47■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 STAC3Q96MF2 364 aa26.46■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 DIP2AQ14689 1571 aa26.46■■□□□ 1.83
PTX4-202ENST00000440447 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.45■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 IFT172Q9UG01 1749 aa26.45■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.44■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 KCNA6P17658 529 aa26.44■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 MYOM2P54296 1465 aa26.43■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.43■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 PIK3R4Q99570 1358 aa26.42■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 CERKQ8TCT0 537 aa26.4■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 PIK3C2GO75747 1445 aa26.39■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 CPS1P31327 1500 aa26.39■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTX4-202ENST00000440447 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.38■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 ALKQ9UM73 1620 aa26.38■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.38■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 METP08581 1390 aa26.37■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.37■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.35■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PTX4-202ENST00000440447 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.33■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 NWD1Q149M9 1564 aa26.33■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 TONSLQ96HA7 1378 aa26.33■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 PTPRUQ92729 1446 aa26.32■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.32■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.29■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.28■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.27■■□□□ 1.8
PTX4-202ENST00000440447 TMEM94Q12767 1356 aa26.25■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 LAMC1P11047 1609 aa26.25■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.24■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 STK26Q9P289 416 aa26.23■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.21■■□□□ 1.79
PTX4-202ENST00000440447 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 ABCC11Q96J66 1382 aa26.2■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 PTCH1Q13635 1447 aa26.18■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 C14orf37Q86TY3 774 aa26.18■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.18■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.18■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.17■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 ADGRB1O14514 1584 aa26.15■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 TECPR2O15040 1411 aa26.14■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.14■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 MSH6P52701 1360 aa26.14■■□□□ 1.78
PTX4-202ENST00000440447 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.13■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.12■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 TOM1O60784 492 aa26.12■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.12■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 FBXO41Q8TF61 875 aa26.12■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 SIRT1Q96EB6 747 aa26.12■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.11■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.11■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.09■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.08■■□□□ 1.77
PTX4-202ENST00000440447 DLC1Q96QB1 1528 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 PRAM1Q96QH2 718 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 POGKQ9P215 609 aa26.06■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 ATF3P18847 181 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.05■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.04■■□□□ 1.76
PTX4-202ENST00000440447 DCCP43146 1447 aa26.01■■□□□ 1.75
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