RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439969.2

C6orf223-202, Transcript of chromosome 6 open reading frame 223, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C6orf223, Length 2,757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223-202ENST00000439969 CDCA8Q53HL2 280 aa25.24■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.24■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.23■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.22■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 NOS1P29475 1434 aa25.21■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 PPP2R1AP30153 589 aa25.21■■□□□ 1.63
C6orf223-202ENST00000439969 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.19■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.19■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 NPATQ14207 1427 aa25.18■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 IQGAP1P46940 1657 aa25.16■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.16■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
C6orf223-202ENST00000439969 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.14■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.12■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.12■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.11■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 KIF1BO60333 1816 aa25.11■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 PLIN1O60240 522 aa25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 ABCA6Q8N139 1617 aa25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 MROH2AA6NES4 1674 aa25.1■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.09■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C6orf223-202ENST00000439969 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.08■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.06■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 MYOM2P54296 1465 aa25.06■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.06■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 PDE3BQ13370 1112 aa25.06■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 ERVK-7P63135 1459 aa25.06■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.05■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 IDI1Q13907 227 aa25.05■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 STK26Q9P289 416 aa25.04■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.03■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.03■■□□□ 1.6
C6orf223-202ENST00000439969 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.01■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 ABCC3O15438 1527 aa25.01■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 SYNMO15061 1565 aa25■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 NEO1Q92859 1461 aa24.99■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 ADGRB3O60242 1522 aa24.99■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.98■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 APAF1O14727 1248 aa24.96■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 SLC24A1O60721 1099 aa24.96■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 MLECQ14165 292 aa24.96■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.95■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 PIK3C2GO75747 1445 aa24.95■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 MSH5O43196 834 aa24.95■■□□□ 1.59
C6orf223-202ENST00000439969 MYOM1P52179 1685 aa24.95■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.94■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 MORC1Q86VD1 984 aa24.93■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 CABP2Q9NPB3 220 aa24.93■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.93■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.92■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.92■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 IFT172Q9UG01 1749 aa24.92■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.9■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.9■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.9■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.9■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 GOLGA2Q08379 1002 aa24.89■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.89■■□□□ 1.58
C6orf223-202ENST00000439969 NEUROD2Q15784 382 aa24.89■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 CRBNQ96SW2 442 aa24.89■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.88■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.87■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.87■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.87■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 PPLO60437 1756 aa24.85■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.84■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.84■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 ADGRB1O14514 1584 aa24.84■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 SKAP1Q86WV1 359 aa24.84■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 INSRP06213 1382 aa24.83■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 EVC2Q86UK5 1308 aa24.83■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.83■■□□□ 1.57
C6orf223-202ENST00000439969 TSPOAP1O95153 1857 aa24.82■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 RICTORQ6R327 1708 aa24.82■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.82■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 MTHFSP49914 203 aa24.8■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 ZNF521Q96K83 1311 aa24.8■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 POGKQ9P215 609 aa24.8■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.79■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 SLFN5Q08AF3 891 aa24.79■■□□□ 1.56
C6orf223-202ENST00000439969 PRAM1Q96QH2 718 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms