RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.89■□□□□ 0.45
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PTPRU-204ENST00000428026 USP47Q96K76 1375 aa17.72■□□□□ 0.43
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PTPRU-204ENST00000428026 PRM3Q9NNZ6 103 aa17.71■□□□□ 0.43
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PTPRU-204ENST00000428026 HOMER1Q86YM7 354 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 IQGAP2Q13576 1575 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
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PTPRU-204ENST00000428026 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.7■□□□□ 0.42
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PTPRU-204ENST00000428026 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.69■□□□□ 0.42
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PTPRU-204ENST00000428026 RNF214Q8ND24 703 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 BICD2Q8TD16 824 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 C22orf23Q9BZE7 217 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 IFT57Q9NWB7 429 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 HECW1Q76N89 1606 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 CABP2Q9NPB3 220 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 TEX35Q5T0J7 233 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 REC8O95072 547 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 CEP89Q96ST8 783 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 MRE11P49959 708 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRU-204ENST00000428026 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.65■□□□□ 0.42
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