RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 BCANQ96GW7 911 aa37.19■■■■□ 3.54
HTATSF1-202ENST00000425695 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFYVE9O95405 1425 aa37.16■■■■□ 3.54
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPM2O94759 1503 aa37.15■■■■□ 3.54
HTATSF1-202ENST00000425695 CLTCL1P53675 1640 aa37.14■■■■□ 3.54
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.13■■■■□ 3.53
HTATSF1-202ENST00000425695 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.11■■■■□ 3.53
HTATSF1-202ENST00000425695 CPS1P31327 1500 aa37.05■■■■□ 3.52
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.04■■■■□ 3.52
HTATSF1-202ENST00000425695 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.04■■■■□ 3.52
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF1BO60333 1816 aa37.03■■■■□ 3.52
HTATSF1-202ENST00000425695 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.01■■■■□ 3.51
HTATSF1-202ENST00000425695 HRCP23327 699 aa36.96■■■■□ 3.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.93■■■■□ 3.5
HTATSF1-202ENST00000425695 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.93■■■■□ 3.5
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNA6P17658 529 aa36.92■■■■□ 3.5
HTATSF1-202ENST00000425695 TBX22Q9Y458 520 aa36.91■■■■□ 3.5
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.9■■■■□ 3.5
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.88■■■■□ 3.49
HTATSF1-202ENST00000425695 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.88■■■■□ 3.49
HTATSF1-202ENST00000425695 RGL3Q3MIN7 710 aa36.87■■■■□ 3.49
HTATSF1-202ENST00000425695 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.82■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 TOM1O60784 492 aa36.77■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 DIP2AQ14689 1571 aa36.77■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.76■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.76■■■■□ 3.48
HTATSF1-202ENST00000425695 NWD1Q149M9 1564 aa36.75■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.75■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM94Q12767 1356 aa36.75■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PIP4K2BP78356 416 aa36.74■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.73■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PPLO60437 1756 aa36.73■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.71■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3R4Q99570 1358 aa36.7■■■■□ 3.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPRUQ92729 1446 aa36.68■■■■□ 3.46
HTATSF1-202ENST00000425695 METP08581 1390 aa36.68■■■■□ 3.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.66■■■■□ 3.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ALKQ9UM73 1620 aa36.61■■■■□ 3.45
HTATSF1-202ENST00000425695 C14orf37Q86TY3 774 aa36.59■■■■□ 3.45
HTATSF1-202ENST00000425695 IFT172Q9UG01 1749 aa36.59■■■■□ 3.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MSH6P52701 1360 aa36.53■■■■□ 3.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
HTATSF1-202ENST00000425695 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.48■■■■□ 3.43
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA1LP34931 641 aa36.47■■■■□ 3.43
HTATSF1-202ENST00000425695 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.47■■■■□ 3.43
HTATSF1-202ENST00000425695 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.45■■■■□ 3.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3C2GO75747 1445 aa36.44■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.44■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.44■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 STK26Q9P289 416 aa36.42■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 MYOM2P54296 1465 aa36.41■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.4■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 ATF3P18847 181 aa36.39■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 SLAIN2Q9P270 581 aa36.39■■■■□ 3.42
HTATSF1-202ENST00000425695 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.38■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.37■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.35■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.33■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.33■■■■□ 3.41
HTATSF1-202ENST00000425695 PTCH1Q13635 1447 aa36.32■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.31■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.29■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 NEUROD1Q13562 356 aa36.28■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.27■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 STAC3Q96MF2 364 aa36.27■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.26■■■■□ 3.4
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.25■■■■□ 3.39
HTATSF1-202ENST00000425695 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.24■■■■□ 3.39
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC11Q96J66 1382 aa36.24■■■■□ 3.39
HTATSF1-202ENST00000425695 LAMC1P11047 1609 aa36.23■■■■□ 3.39
HTATSF1-202ENST00000425695 DCCP43146 1447 aa36.22■■■■□ 3.39
HTATSF1-202ENST00000425695 TECPR2O15040 1411 aa36.19■■■■□ 3.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.18■■■■□ 3.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.16■■■■□ 3.38
HTATSF1-202ENST00000425695 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.16■■■■□ 3.38
HTATSF1-202ENST00000425695 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.15■■■■□ 3.38
HTATSF1-202ENST00000425695 MST1RQ04912 1400 aa36.15■■■■□ 3.38
HTATSF1-202ENST00000425695 BRINP3Q76B58 766 aa36.13■■■■□ 3.37
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.12■■■■□ 3.37
HTATSF1-202ENST00000425695 SIRT1Q96EB6 747 aa36.11■■■■□ 3.37
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRB1O14514 1584 aa36.1■■■■□ 3.37
HTATSF1-202ENST00000425695 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.37
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAM1Q96QH2 718 aa36.09■■■■□ 3.37
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